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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 如何预测蛋白的活性位点啊？
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lusandanooo

银虫 (小有名气)

[求助] 如何预测蛋白的活性位点啊？ 已有2人参与

新手菜鸟，用autodock做分子对接，对接结果显示ligand周围有几个氨基酸，我想知道这些氨基酸是不是活性位点。我做的这个蛋白没有相似度很高的已知晶体结构，也没有文献报道过其活性位点。希望各位虫友们能推荐一些预测活性位点的在线网站，不胜感激！
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毕了业真开心嘻嘻嘻嘻嘻
1楼 2016-05-13 16:58:27
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殷赋科技

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
lusandanooo: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2016-05-24 17:15:13
网上搜索一下一大堆，不妨看看这个：“http://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/COACH/”。
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2楼2016-05-13 17:41:47
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lusandanooo

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 殷赋科技 at 2016-05-13 17:41:47
网上搜索一下一大堆，不妨看看这个：“http://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/COACH/”。

我不求一大堆……您能给我说一个好用免费的就行……

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毕了业真开心嘻嘻嘻嘻嘻
3楼2016-05-14 11:10:38
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lusandanooo

银虫 (小有名气)
up
4楼2016-05-16 11:04:33
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好孩子坏孩子

金虫 (著名写手)
这个好像是没有比较直观的方法，只能根据前人经验推测

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5楼2016-05-16 23:31:40
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longytu

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

你的蛋白结构从哪里获得？同源建模可以参考模板蛋白
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6楼2016-05-23 11:28:19
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