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fzhrobin

木虫 (正式写手)

[交流] 得到差异蛋白,我们能做什么

大家好!有个疑问也是困惑想请教大家
如果我得到两个植物样品(一个对照和一个逆境胁迫处理)的差异蛋白,也预测到差异蛋白它们可能的功能,那么接下来从蛋白质组学的角度研究的话,我们能做些哪方面的研究呢?
查到的文献,很多都是先做2-D电泳,找出差异蛋白,然后用软件进行分析,预测功能(或者直接通过高分辨质谱找出差异蛋白)。大多数之后没有后文了(一篇文章到此结束),要不就到了基因层面,再进行west-blot验证。如果我们从蛋白的角度出发,不涉及基因的话,我们还能做些什么研究呢?疑惑之处,请大家帮忙解答。

或者大家有新的思路,欢迎分享
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~!


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引用回帖:
9楼: Originally posted by fzhrobin at 2016-06-13 14:21:30
请问,通路分析对于没有一点相关基础或者说背景的人来说,上手快不快?是不是都是利用一些软件进行的分析呢?我们是刚刚起步,准备做点蛋白质组学方面的研究...

得到ID或者序列,然后使用KABOS2.0 (北大数据库)就可以得到KEGG和GO的结果了
11楼2016-06-14 10:10:18
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狂狼222

禁虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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3楼2016-05-13 11:24:37
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~!


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
差异蛋白GO,KEGG分类与富集;
再看富集到的GO或KEGG分类主要涉及什么功能;
如果还有文献报道表达水平,可以看一下表达水平与翻译水平的相关性;
如果要发高水平的文章,应该需要再做实验验证的吧?
4楼2016-05-13 12:36:38
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爱情曼陀罗

新虫 (著名写手)

5楼2016-05-14 12:58:16
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