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guodianzhu

新虫 (小有名气)

[求助] 高斯计算氢自由基 已有3人参与

小菜一枚想用高斯计算氢自由基的能量，我添加了虚原子（如图），但计算不了，请大神们指导！

高斯计算氢自由基
捕获.PNG


高斯计算氢自由基-1
捕获.JPG
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1楼 2016-05-12 09:14:17
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guodianzhu

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by paramecium86 at 2016-05-12 11:55:43
仅就这个输入文件看 没啥问题 该是可以算的 错误提示是什么？
...

没有输出文件！这是怎么回事呢？
高斯计算氢自由基-2
1.JPG


高斯计算氢自由基-3
2.JPG
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5楼2016-05-12 13:10:54
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普通回帖

zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
我算时的输入：

# HF/6-311++G** POP=FULL IOP(6/7=3)   

H  

0,2
1   0.0 0.0 0.0
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2楼2016-05-12 10:23:17
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guodianzhu

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhou2009 at 2016-05-12 10:23:17
我算时的输入：

# HF/6-311++G** POP=FULL IOP(6/7=3)   

H  

0,2
1   0.0 0.0 0.0

你好，能截屏一个完整的坐标给我吗？谢谢你！
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杂质中
3楼2016-05-12 10:33:43
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paramecium86

版主 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhou2009 at 2016-05-12 10:23:17
我算时的输入：

# HF/6-311++G** POP=FULL IOP(6/7=3)   

H  

0,2
1   0.0 0.0 0.0

仅就这个输入文件看 没啥问题 该是可以算的 错误提示是什么？

发自小木虫IOS客户端
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4楼2016-05-12 11:55:43
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zhou2009

版主 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by guodianzhu at 2016-05-12 10:33:43
你好，能截屏一个完整的坐标给我吗？谢谢你！...

这就是一个完整的坐标。
一个H，放在坐标原点。为什么用虚拟原子呢？
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6楼2016-05-12 15:11:53
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guodianzhu

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by zhou2009 at 2016-05-12 15:11:53
这就是一个完整的坐标。
一个H，放在坐标原点。为什么用虚拟原子呢？...

你好，如果不加虚原子，坐标文件如图，计算时没有输出文件，即计算不了。经建议，需要加一个虚原子才能算！请问你是怎么算的？谢谢！
高斯计算氢自由基-4
3.JPG
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7楼2016-05-12 22:01:53
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paramecium86

版主 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by guodianzhu at 2016-05-12 13:10:54
没有输出文件！这是怎么回事呢？

1.JPG

2.JPG
...

我用你的输入文件
%chk=h.chk
# HF/6-311++G** POP=FULL IOP(6/7=3)   

H  

0,2
1   0.0 0.0 0.0

放到我这里的超算上算是没有问题的。是可以算出结果的 我把输出的log文件附上了

如果连log都没有生成 基本不会是内容本身有问题 该是运行指令是不是没输入准确。看你有sh文件 是不是sh文件里面指令没有写好？
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    • 2016-05-13 05:37:13, 18.75 K
8楼2016-05-13 05:38:02
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paramecium86

版主 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by guodianzhu at 2016-05-12 13:10:54
没有输出文件！这是怎么回事呢？

1.JPG

2.JPG
...

上一个帖子忘记 我把用的输入文件放上来好了 就用的单独一个H原子
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9楼2016-05-13 05:43:03
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zhou2009

版主 (著名写手)
加关键词：IOP(6/7=3)
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10楼2016-05-13 08:27:49
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