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| 计算中出现： Add virtual bond connecting atoms F43 and H37 Dist= 2.46D+00. 请问各位大侠如何解决！！ |
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xieruobing
木虫 (著名写手)
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2楼2016-05-12 08:40:16
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Charge = -1 Multiplicity = 1 C -2.61712 -0.14546 1.26296 N -1.96626 -0.86304 0.43783 B -0.47526 -0.9825 0.63582 N 0.21323 0.25199 1.18127 C -0.58649 1.24848 1.20875 C -1.98234 1.12813 1.84787 C -3.82274 -0.67027 1.50592 C -3.85565 -1.7825 0.76045 C -2.68102 -1.87127 0.11096 C 1.25508 0.65029 0.55036 C 1.05627 1.88223 0.05248 C -0.12908 2.29371 0.50939 C -2.34746 -2.98383 -0.8459 C -4.88955 -0.13321 2.40904 C -0.80275 3.60659 0.25277 F -0.28806 -2.1467 1.6353 F 0.14154 -1.38931 -0.72228 N 2.31039 0.02925 0.21695 C 2.59263 -1.69642 1.74848 C 2.92028 -1.00179 0.64487 C 4.00647 -1.39268 -0.04903 C 4.71836 -2.46884 0.32127 C 4.36149 -3.16808 1.40824 C 3.29917 -2.77396 2.12546 H -2.61529 2.02926 1.73579 H -4.69357 -2.48733 0.69415 H 1.73451 2.46087 -0.58783 H -3.21554 -3.66034 -1.01196 H -1.50891 -3.60188 -0.45403 H -2.05124 -2.56773 -1.835 H -5.24775 0.85202 2.03315 H -5.76374 -0.82041 2.46165 H -4.49415 0.00267 3.44087 H -1.00873 4.13077 1.21324 H -0.16539 4.27178 -0.3718 H -1.76508 3.45093 -0.28533 H 2.79794 0.49266 -0.592 H 1.7611 -1.38032 2.39457 H 4.33189 -0.84168 -0.94877 H 5.59931 -2.7782 -0.26633 H 4.94748 -4.04865 1.71971 H 3.01804 -3.32768 3.03726 F 3.78116 1.33592 -0.4816 Add virtual bond connecting atoms F43 and H37 Dist= 2.46D+00. 一个F离子的拔氢反应。还没算就直接死掉了。 谢谢回复！ |
3楼2016-05-12 10:36:59
不取俗名
木虫 (正式写手)
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4楼2016-05-12 15:50:22
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这是我贴出的out文件。 下面是输入文件 #um062x/6-31+g* opt=(TS,calcfc) iop(1/11=1) freq scf=tight test XX -1 1 C -2.61711500 -0.14545900 1.26296200 N -1.96625500 -0.86304200 0.43782900 B -0.47525900 -0.98250200 0.63582100 N 0.21323300 0.25198600 1.18126600 C -0.58649200 1.24848000 1.20874900 C -1.98233800 1.12812800 1.84787000 C -3.82273900 -0.67026500 1.50591800 C -3.85565200 -1.78249700 0.76045300 C -2.68101600 -1.87127200 0.11095800 C 1.25507900 0.65028600 0.55036000 C 1.05626500 1.88222800 0.05248100 C -0.12907800 2.29371100 0.50939400 C -2.34745700 -2.98382700 -0.84590000 C -4.88955000 -0.13320900 2.40904000 C -0.80274700 3.60659100 0.25277300 F -0.28805900 -2.14669600 1.63529800 F 0.14153500 -1.38930700 -0.72227900 N 2.31039300 0.02924600 0.21694900 C 2.59263300 -1.69642100 1.74847900 C 2.92028100 -1.00179100 0.64487000 C 4.00646600 -1.39268200 -0.04903000 C 4.71836000 -2.46883900 0.32126600 C 4.36149200 -3.16808000 1.40823500 C 3.29916600 -2.77396200 2.12546300 H -2.61529300 2.02926300 1.73578700 H -4.69356900 -2.48732800 0.69415200 H 1.73451400 2.46086900 -0.58782600 H -3.21553800 -3.66033500 -1.01196300 H -1.50891400 -3.60187700 -0.45402500 H -2.05123600 -2.56772500 -1.83500400 H -5.24774500 0.85201500 2.03315100 H -5.76374200 -0.82040800 2.46165300 H -4.49414600 0.00266600 3.44087100 H -1.00873500 4.13076600 1.21324400 H -0.16539400 4.27178000 -0.37180400 H -1.76508400 3.45092900 -0.28532900 H 2.79794000 0.49265600 -0.59199900 H 1.76109700 -1.38032300 2.39457100 H 4.33188600 -0.84167500 -0.94877100 H 5.59930600 -2.77819700 -0.26632700 H 4.94747800 -4.04865100 1.71971100 H 3.01803900 -3.32767700 3.03725800 F 3.93242579 1.46564875 -0.46461332 |
5楼2016-05-12 16:40:20
6楼2016-05-12 16:50:05
tanxyouxian
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