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jxxyshxy

银虫 (初入文坛)

[求助] 高斯构型优化计算报错! 已有2人参与

计算中出现: Add virtual bond connecting atoms F43        and H37        Dist= 2.46D+00.  请问各位大侠如何解决!!
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xieruobing

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你要把具体的输入和输出贴出来,单独这样一段,很难知道指什么的
2楼2016-05-12 08:40:16
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jxxyshxy

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xieruobing at 2016-05-12 08:40:16
你要把具体的输入和输出贴出来,单独这样一段,很难知道指什么的

Charge = -1 Multiplicity = 1
C                    -2.61712  -0.14546   1.26296
N                    -1.96626  -0.86304   0.43783
B                    -0.47526  -0.9825    0.63582
N                     0.21323   0.25199   1.18127
C                    -0.58649   1.24848   1.20875
C                    -1.98234   1.12813   1.84787
C                    -3.82274  -0.67027   1.50592
C                    -3.85565  -1.7825    0.76045
C                    -2.68102  -1.87127   0.11096
C                     1.25508   0.65029   0.55036
C                     1.05627   1.88223   0.05248
C                    -0.12908   2.29371   0.50939
C                    -2.34746  -2.98383  -0.8459
C                    -4.88955  -0.13321   2.40904
C                    -0.80275   3.60659   0.25277
F                    -0.28806  -2.1467    1.6353
F                     0.14154  -1.38931  -0.72228
N                     2.31039   0.02925   0.21695
C                     2.59263  -1.69642   1.74848
C                     2.92028  -1.00179   0.64487
C                     4.00647  -1.39268  -0.04903
C                     4.71836  -2.46884   0.32127
C                     4.36149  -3.16808   1.40824
C                     3.29917  -2.77396   2.12546
H                    -2.61529   2.02926   1.73579
H                    -4.69357  -2.48733   0.69415
H                     1.73451   2.46087  -0.58783
H                    -3.21554  -3.66034  -1.01196
H                    -1.50891  -3.60188  -0.45403
H                    -2.05124  -2.56773  -1.835
H                    -5.24775   0.85202   2.03315
H                    -5.76374  -0.82041   2.46165
H                    -4.49415   0.00267   3.44087
H                    -1.00873   4.13077   1.21324
H                    -0.16539   4.27178  -0.3718
H                    -1.76508   3.45093  -0.28533
H                     2.79794   0.49266  -0.592
H                     1.7611   -1.38032   2.39457
H                     4.33189  -0.84168  -0.94877
H                     5.59931  -2.7782   -0.26633
H                     4.94748  -4.04865   1.71971
H                     3.01804  -3.32768   3.03726
F                     3.78116   1.33592  -0.4816

Add virtual bond connecting atoms F43        and H37        Dist= 2.46D+00.
一个F离子的拔氢反应。还没算就直接死掉了。  谢谢回复!
3楼2016-05-12 10:36:59
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不取俗名

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by jxxyshxy at 2016-05-12 10:36:59
Charge = -1 Multiplicity = 1
C                    -2.61712  -0.14546   1.26296
N                    -1.96626  -0.86304   0.43783
B                    -0.47526  -0.9825    0.63582
N        ...

第一行应该是-1 1,不用写那两个英文,而且那个也不应该是第一行,你前面的命令行呢?

发自小木虫Android客户端
4楼2016-05-12 15:50:22
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jxxyshxy

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 不取俗名 at 2016-05-12 15:50:22
第一行应该是-1 1,不用写那两个英文,而且那个也不应该是第一行,你前面的命令行呢?
...

这是我贴出的out文件。

下面是输入文件
#um062x/6-31+g*  opt=(TS,calcfc) iop(1/11=1) freq scf=tight test

XX

-1  1
C                 -2.61711500   -0.14545900    1.26296200
N                 -1.96625500   -0.86304200    0.43782900
B                 -0.47525900   -0.98250200    0.63582100
N                  0.21323300    0.25198600    1.18126600
C                 -0.58649200    1.24848000    1.20874900
C                 -1.98233800    1.12812800    1.84787000
C                 -3.82273900   -0.67026500    1.50591800
C                 -3.85565200   -1.78249700    0.76045300
C                 -2.68101600   -1.87127200    0.11095800
C                  1.25507900    0.65028600    0.55036000
C                  1.05626500    1.88222800    0.05248100
C                 -0.12907800    2.29371100    0.50939400
C                 -2.34745700   -2.98382700   -0.84590000
C                 -4.88955000   -0.13320900    2.40904000
C                 -0.80274700    3.60659100    0.25277300
F                 -0.28805900   -2.14669600    1.63529800
F                  0.14153500   -1.38930700   -0.72227900
N                  2.31039300    0.02924600    0.21694900
C                  2.59263300   -1.69642100    1.74847900
C                  2.92028100   -1.00179100    0.64487000
C                  4.00646600   -1.39268200   -0.04903000
C                  4.71836000   -2.46883900    0.32126600
C                  4.36149200   -3.16808000    1.40823500
C                  3.29916600   -2.77396200    2.12546300
H                 -2.61529300    2.02926300    1.73578700
H                 -4.69356900   -2.48732800    0.69415200
H                  1.73451400    2.46086900   -0.58782600
H                 -3.21553800   -3.66033500   -1.01196300
H                 -1.50891400   -3.60187700   -0.45402500
H                 -2.05123600   -2.56772500   -1.83500400
H                 -5.24774500    0.85201500    2.03315100
H                 -5.76374200   -0.82040800    2.46165300
H                 -4.49414600    0.00266600    3.44087100
H                 -1.00873500    4.13076600    1.21324400
H                 -0.16539400    4.27178000   -0.37180400
H                 -1.76508400    3.45092900   -0.28532900
H                  2.79794000    0.49265600   -0.59199900
H                  1.76109700   -1.38032300    2.39457100
H                  4.33188600   -0.84167500   -0.94877100
H                  5.59930600   -2.77819700   -0.26632700
H                  4.94747800   -4.04865100    1.71971100
H                  3.01803900   -3.32767700    3.03725800
F                  3.93242579    1.46564875   -0.46461332
5楼2016-05-12 16:40:20
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jxxyshxy

银虫 (初入文坛)

已经解决了。谢谢!
6楼2016-05-12 16:50:05
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tanxyouxian

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by jxxyshxy at 2016-05-12 16:50:05
已经解决了。谢谢!

请问楼主怎么解决的呢?
7楼2016-11-11 17:21:52
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