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Mandy 王曼曼

新虫 (初入文坛)

[交流] 质粒酶切回收 已有6人参与

PLKO.1质粒9000bp,双酶切出7000bp和2000bp的片段,跑电泳(1%琼脂糖)条带正确且清晰,回收质粒用的TIANGEN的,回收后测浓度和吸光值,D260/D280只有1.5甚至更低,操作很小心,好几次都这样,找不到原因,求帮助分析下。谢谢了!
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
天根胶回收产物直接吸光法测浓度,有的时候会有很大误差,回收产物中残留多糖影响吸光法定量,不如跑个电泳看下。
2楼2016-05-05 23:08:32
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张凡云

至尊木虫 (职业作家)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
是你本来酶切的量不够吗?你切了多大体系,回收最后多少洗脱的

发自小木虫IOS客户端
3楼2016-05-06 09:02:18
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Mandy 王曼曼

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2016-05-05 23:08:32
天根胶回收产物直接吸光法测浓度,有的时候会有很大误差,回收产物中残留多糖影响吸光法定量,不如跑个电泳看下。

您是说,回收的那部分再跑个电泳吗?
4楼2016-05-06 10:00:59
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Mandy 王曼曼

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 张凡云 at 2016-05-06 09:02:18
是你本来酶切的量不够吗?你切了多大体系,回收最后多少洗脱的

量是够的,50ul的体系,4ug的质粒,50ul  洗脱的。浓度也还好,11ng/ul,就是吸光值有问题。D260都没峰。
5楼2016-05-06 10:05:15
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)


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引用回帖:
4楼: Originally posted by Mandy 王曼曼 at 2016-05-06 10:00:59
您是说,回收的那部分再跑个电泳吗?...

对,一般上样2ul就可以。
6楼2016-05-06 12:57:41
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Mandy 王曼曼

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2016-05-05 23:08:32
天根胶回收产物直接吸光法测浓度,有的时候会有很大误差,回收产物中残留多糖影响吸光法定量,不如跑个电泳看下。

回收的7000bp又跑电泳,结果如图所示:左边是样,右边是marker(最上面为7000bp)。7000bp处有条带,但是有拖尾,这意味着被降解了吗?
质粒酶切回收
~27H%ONRBMQ1YMZ2OW32[7O.png

7楼2016-05-06 13:05:03
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by Mandy 王曼曼 at 2016-05-06 13:05:03
回收的7000bp又跑电泳,结果如图所示:左边是样,右边是marker(最上面为7000bp)。7000bp处有条带,但是有拖尾,这意味着被降解了吗?

~27H%ONRBMQ1YMZ2OW32[7O.png
...

可以继续往下做,没有问题。
8楼2016-05-06 13:13:48
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wchuangqi

铜虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
感觉问题不大,可以在回收的时候增加一步wash,看看260/280会不会好点
天道酬勤
9楼2016-05-07 00:23:29
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cvbst

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
胶回收产物用电泳鉴定就行了,以后别用紫外检测了。

发自小木虫Android客户端
10楼2016-05-07 09:20:54
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