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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 差分电荷密度
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xzkwo

新虫 (小有名气)

[求助] 差分电荷密度 已有1人参与

求助MS的castep模块计算的一个分子与表面吸附体系的电荷差分密度是谁减谁的电荷密度差，是计算后体系的总电荷密度减去原来各个对应孤立原子的电荷密度差？还是总电荷密度减去分子的电荷密度和表面模型的电荷密度？
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1楼 2016-05-04 20:57:21
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xzkwo

新虫 (小有名气)
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引用回帖:
2楼: Originally posted by kryang at 2016-05-05 09:04:03
最后一种，一般大部分文献只要涉及到这类计算，都会将公式罗列出来，可参考相关文献。

请问在计算时选择可 atomic densities ，是不是就是第一种差分，而 sets of atoms 就是第二种差分？

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3楼2016-05-05 15:23:15
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普通回帖

kryang

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
最后一种，一般大部分文献只要涉及到这类计算，都会将公式罗列出来，可参考相关文献。
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xzkwo
2楼2016-05-05 09:04:03
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kryang

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by xzkwo at 2016-05-05 15:23:15
请问在计算时选择可 atomic densities ，是不是就是第一种差分，而 sets of atoms 就是第二种差分？
...

我没有用过castep模块，我一般用vesta来处理差分电荷密度。但是这也比较容易解决，用一个简单的体系，分别用atomic densities，sets of atoms，both atomic densities and sets of atoms三种方法都试一下，从结果中可以得知。
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4楼2016-05-06 09:07:28
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kryang

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
xzkwo: 金币+10, ★★★很有帮助 2016-05-06 13:00:37
找到一个资源，ppt手把手地教怎么做差分电荷密度，上面好像用的是第三种方法。
http://wenku.baidu.com/link?url= ... ATC4OSGmiEpM9zmbQ_3
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5楼2016-05-06 09:16:11
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xzkwo

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by kryang at 2016-05-06 09:16:11
找到一个资源，ppt手把手地教怎么做差分电荷密度，上面好像用的是第三种方法。
http://wenku.baidu.com/link?url=sYszuhq0mTZAAdyq6yJHh61zoNFQbj6dKiJsK4KA7UHl4Ty8-5ZLQYd9rmxIe0ItUd6O8QFpkxz0Yz2UAW1Ri4VLATC4 ...

嗯，好的，谢谢！
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6楼2016-05-06 13:00:56
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xzkwo

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by kryang at 2016-05-06 09:16:11
找到一个资源，ppt手把手地教怎么做差分电荷密度，上面好像用的是第三种方法。
http://wenku.baidu.com/link?url=sYszuhq0mTZAAdyq6yJHh61zoNFQbj6dKiJsK4KA7UHl4Ty8-5ZLQYd9rmxIe0ItUd6O8QFpkxz0Yz2UAW1Ri4VLATC4 ...

另外我再问一个问题，我在做表面吸附时，优化后吸附质的态密度峰左移，峰变低，而与之对应的表面模型上的原子的态密度几乎没有变化。看文献说应该有一定程度的右移，向非占据态移动。不知道这是为什么，请赐教
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7楼2016-05-06 13:33:23
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kryang

银虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by xzkwo at 2016-05-06 13:33:23
另外我再问一个问题，我在做表面吸附时，优化后吸附质的态密度峰左移，峰变低，而与之对应的表面模型上的原子的态密度几乎没有变化。看文献说应该有一定程度的右移，向非占据态移动。不知道这是为什么，请赐教...

赐教不敢，但愿意讨论~~
我认为可能还是与吸附质、表面有关，甚至和计算方法也有关。

按我的经验，我算过的是有机小分子吸附到金属表面，如果“表面模型上的原子的态密度几乎没有变化”，那么表面应该是不吸附这种吸附质；相对应的，吸附质的DOS也变负，可能表示吸附质也不倾向于吸附到表面上。
而文献中“右移”，应该是变得更正，吸附作用应该是增强的。
如果这么分析，你的结果与文献相反了。
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8楼2016-05-06 18:08:27
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xzkwo

新虫 (小有名气)
我算的是水分子在碳酸钠晶体表面的吸附，而之前提到的优化后构型从布局数分析水分子的 H 与表面的 O 布居数为0.0几，应该是有吸附作用的，并且优化后H2O向表面靠近。我提到的那个文献里是说吸附质得到了电子，态密度左移 ；而表面上的对应的原子失去电子，其态密度右移而更正。

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9楼2016-05-07 00:38:54
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xzkwo

新虫 (小有名气)
接上，手贱按错了

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10楼2016-05-07 00:39:25
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