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rcliutao金虫 (正式写手)
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[交流]
【求助】请教画分子点群图的软件或者其他方式能画出分子点群图
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我是做大分子的，最近在GV里画得图，对称性把握不好，现在想请教帮我解决这个问题，比如说这个分子告你是D3点群，让你画出这个分子，在什么软件里画这比较好，或者其他方式能得出这个分子也行 [ Last edited by zzgyb on 2008-10-28 at 17:38 ] |
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rcliutao
金虫 (正式写手)
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3楼2008-10-31 09:21:50
zhangfq7112
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mingdong(金币+2,VIP+0):谢谢您的帮助
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以构建环戊烯基D5h对称结构为例，在GV中先构建环戊二烯分子结构，删除SP3碳上的二个氢原子，再给该碳原子添加 一个氢。然后从编辑菜单中选择“Point group...”命令，打开点群搜索设置对话框。 先勾选“Enable Point Group Symmetry”选项，再从“Tolerance”下拉列表中选择“Very loose (0.3)”，点击“Symmetrize”按钮，将当前分子对称化为“D5h”点群。为使后面的操作中保持分子的对称性不变，勾选“Always track point group symmetry”选项。从“Constrain to subgroup”下拉列表中，选择“D5h”，然后点击“OK”按钮完成分子对称性的调整。 此时该结构被对称化为D5h点群。利用键长调整工具将任一个C-C键长设为1.44Å，键型设为“共轭双键”，则其余四个C-C键都拥有同等键长和键型，此时，具有D5h对称性的环戊烯基的中心就是坐标原点。 |
6楼2008-10-31 14:53:06