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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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rcliutao

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】请教画分子点群图的软件或者其他方式能画出分子点群图

我是做大分子的,最近在GV里画得图,对称性把握不好,现在想请教帮我解决这个问题,比如说这个分子告你是D3点群,让你画出这个分子,在什么软件里画这比较好,或者其他方式能得出这个分子也行

[ Last edited by zzgyb on 2008-10-28 at 17:38 ]
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zhangfq7112

银虫 (正式写手)

用MaterialsStudio


zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
用MaterialsStudio做,再导出来
2楼2008-10-29 10:23:10
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rcliutao

金虫 (正式写手)

zhangfq7112 ,谢谢你的回复,能不能提供个联系方式,我想请教你问题,急切盼你回复,thank you
3楼2008-10-31 09:21:50
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)


zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
GV就可以自动调整分子的对称性为指定的点群。
4楼2008-10-31 11:39:04
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rcliutao

金虫 (正式写手)

不行呀,怎么调
5楼2008-10-31 11:45:52
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)

★ ★
mingdong(金币+2,VIP+0):谢谢您的帮助
以构建环戊烯基D5h对称结构为例,在GV中先构建环戊二烯分子结构,删除SP3碳上的二个氢原子,再给该碳原子添加 一个氢。然后从编辑菜单中选择“Point group...”命令,打开点群搜索设置对话框。
先勾选“Enable Point Group Symmetry”选项,再从“Tolerance”下拉列表中选择“Very loose (0.3)”,点击“Symmetrize”按钮,将当前分子对称化为“D5h”点群。为使后面的操作中保持分子的对称性不变,勾选“Always track point group symmetry”选项。从“Constrain to subgroup”下拉列表中,选择“D5h”,然后点击“OK”按钮完成分子对称性的调整。
此时该结构被对称化为D5h点群。利用键长调整工具将任一个C-C键长设为1.44Å,键型设为“共轭双键”,则其余四个C-C键都拥有同等键长和键型,此时,具有D5h对称性的环戊烯基的中心就是坐标原点。
6楼2008-10-31 14:53:06
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rcliutao

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by yytsnake at 2008-10-31 14:53:
以构建环戊烯基D5h对称结构为例,在GV中先构建环戊二烯分子结构,删除SP3碳上的二个氢原子,再给该碳原子添加 一个氢。然后从编辑菜单中选择“Point group...”命令,打开点群搜索设置对话框。
先勾选“Enable P ...

太谢谢你了,我试试,你的QQ是多少,想加你为好友,请教问题
7楼2008-10-31 16:10:22
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rcliutao

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by yytsnake at 2008-10-31 14:53:
以构建环戊烯基D5h对称结构为例,在GV中先构建环戊二烯分子结构,删除SP3碳上的二个氢原子,再给该碳原子添加 一个氢。然后从编辑菜单中选择“Point group...”命令,打开点群搜索设置对话框。
先勾选“Enable P ...

你好,我已经试过了,还是不行,但是我仍然感谢你回复我,我觉的你说的那种是画出来图形基本上已经是指定的点群,然后在那里一调就行,我的问题在于分子指定的点群是D3d,而我画出来的是C1,在这种情况下如何调他就成D3d
8楼2008-11-01 09:03:43
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)


zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
一般这样的分子用Z矩阵来手写可能更好一些。你的分子有多大?给个分子式看一下。
9楼2008-11-01 13:28:59
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rcliutao

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by yytsnake at 2008-11-1 13:28:
一般这样的分子用Z矩阵来手写可能更好一些。你的分子有多大?给个分子式看一下。

就这个分子,N24,一共两个三元环,六个五元环,六个六元环,文献里说是D3d点群,你帮给看看,或者给推荐下哪个软件画比较好除了GV和MSViewer这两个你个软件,谢谢你

[ Last edited by rcliutao on 2008-11-1 at 15:19 ]
10楼2008-11-01 15:13:08
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