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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 关闭Intel CPU超线程，VASP速度竟然上去了
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未岸亡灵

铁杆木虫 (著名写手)

暂时离开小木虫

[交流] 关闭Intel CPU超线程，VASP速度竟然上去了 已有9人参与

去年组内购进一台机器，亲自去组装的，配置如下：

两颗 E5-2620 v3 @ 2.40GHz（每颗6核12线程）
内存 16G （带ecc，服务器级的）
硬盘 2*1T （做成RAID0）
主板 华硕 P9-D8

其他就没什么好说的了，也不影响性能。没办法，就项目卡里最后一万块钱，定额配的。

买回来放在哪儿，他们算高斯，一直也没有上VASP，恰好最近做一个体系计算时间的测试，就顺便测试了一下。
结果发现，开启超线程（可交24核作业）和不开超线程（可交12核心作业），结果发现后者速度竟然是前者的一倍，时间减半。

超线程24核作业计算结果：
Start at:Sat Apr 30 08:41:00 EDT 2016
End at:Sat Apr 30 23:41:26 EDT 2016
Total time：15 h 0 min 26s
关闭超线程12核作业计算结果：
Start at:Sun May  1 00:23:43 EDT 2016
End at:Sun May  1 07:48:47 EDT 2016
Total time: 7h 25min 4s

之前就听说过MS计算的时候，开启超线程会减缓速度，具体原因不详，但是本次测试的确也发现了这个问题。
期待大师能够出现在这里给予一些解释。
也在此提醒开启超线程的朋友，是否合理
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1楼 2016-05-02 10:02:50
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

未岸亡灵

铁杆木虫 (著名写手)

暂时离开小木虫
引用回帖:
3楼: Originally posted by aaq2800 at 2016-05-02 14:39:58
请教，如何关闭超线程？？

去BIOS中找Hyper Threding这项，改为Disable就行
如果主板支持的话
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4楼2016-05-02 14:48:18
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jiewei

专家顾问 (著名写手)

小才
★
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楼主的测试只是对部分cpu有效的，我的2660开启超线程算ms是比关掉要快的，虽然快不了一倍，但是确实要快很多。楼主的问题应该出在内存已经硬盘上，我内存192g，用的sas硬盘，可以明显看到开了超线程swap已经内存占有都在上升。所以，个人认为只要内存和硬盘为sas，开启超线程是合理而且很有必要的，上述问题对高斯同样有效

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我想做个科学家，可我又喜欢写诗；我想做一个诗人，可我却读的理工科..
6楼2016-05-02 16:16:48
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djh434325996

木虫 (小有名气)
★
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个人认为超线程只为提升同时执行多个任务的能力，对vasp的计算并没有提速作用。反而在多线程的计算中，频繁的数据交换降低了计算效率。
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10楼2016-05-03 16:35:59
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普通回帖

binarec

木虫 (小有名气)
★
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建议关闭超线程，有对超线程优化（如用openmp）的除外。开启超线程，同时提交12核作业，速度大概比关闭超线程慢百分之几

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2楼2016-05-02 10:30:40
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aaq2800

铁杆木虫 (知名作家)
★
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请教，如何关闭超线程？？
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3楼2016-05-02 14:39:58
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hakuna

木虫 (知名作家)
★
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很正常，超线程本来就是用来忽悠人的
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5楼2016-05-02 15:42:48
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一次性保温杯

金虫 (小有名气)
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引用回帖:
6楼: Originally posted by jiewei at 2016-05-02 00:16:48
楼主的测试只是对部分cpu有效的，我的2660开启超线程算ms是比关掉要快的，虽然快不了一倍，但是确实要快很多。楼主的问题应该出在内存已经硬盘上，我内存192g，用的sas硬盘，可以明显看到开了超线程swap已经内存占有 ...

您好，有个问题请教一下，我是双e5 2670v3 cpu，为什么开启超线程之后MS就打不开了，您有没有遇到这个状况，谢谢啦

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7楼2016-05-03 08:12:02
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未岸亡灵

铁杆木虫 (著名写手)

暂时离开小木虫
引用回帖:
6楼: Originally posted by jiewei at 2016-05-02 16:16:48
楼主的测试只是对部分cpu有效的，我的2660开启超线程算ms是比关掉要快的，虽然快不了一倍，但是确实要快很多。楼主的问题应该出在内存已经硬盘上，我内存192g，用的sas硬盘，可以明显看到开了超线程swap已经内存占有 ...

可能是，这个机器内存就是个鸡肋，合适申请点资金，添添

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8楼2016-05-03 10:44:43
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wuchenwf

荣誉版主 (职业作家)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
有没有服务器直接配个SSD的，企业级的SSD估计比较贵，民用的SSD用作计算的话怎么样。肯定比SAS还要快，不知道可靠性怎样。我觉得应该也不是问题
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9楼2016-05-03 16:04:31
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