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xiulianlin

新虫 (初入文坛)

[求助] 中药指纹图谱数据如何前处理 已有3人参与

刚开始做中药指纹图谱,图来后不知道如何处理数据,也就是图谱中的哪些要积分哪些峰不要积分。谢谢各位虫友!

中药指纹图谱数据如何前处理
dd.jpg
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绘图工作室

禁虫 (小有名气)

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卓越_先锋: 金币-50, 应助指数-1, 屏蔽内容, 违规存档, 禁止在回帖中广告 2016-04-25 18:05:44
本帖内容被屏蔽

2楼2016-04-23 16:16:36
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普思生物

专家顾问 (著名写手)

中药对照品,天然产物分离纯化


【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
xiulianlin(卓越_先锋代发): 金币+2, 谢谢回复 2016-04-26 12:51:51
做指纹图谱一般要选十个批次的药材,找到共有峰,你这个图也没有对照品,没办法判断哪些峰是特征峰

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2016-04-23 19:54:56
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hupulang

禁虫 (初入文坛)

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
xiulianlin(卓越_先锋代发): 金币+2, 谢谢回复 2016-04-26 12:51:58
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4楼2016-04-25 14:20:45
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xiulianlin

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by hupulang at 2016-04-25 14:20:45
理论上应该每个峰都要积分,运用中药指纹图谱相似度计算软件进行全峰匹配才可以,具体也可参考“关于印发《中药注射剂指纹图谱研究的技术要求(暂行)》的通知“

我试了下所有的峰包括那种小峰都积分的话共有峰就差不多有50个了。另外,在匹配结果里可以看到非共有峰面积占的比例,当多点校正点选的越多时,非共有峰的面积就会越少,这个是怎么解释的呢?
5楼2016-04-25 19:47:14
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xiulianlin

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by 普思生物 at 2016-04-23 19:54:56
做指纹图谱一般要选十个批次的药材,找到共有峰,你这个图也没有对照品,没办法判断哪些峰是特征峰

我做了十批的药材,也进了对照,确定了一些峰。现在的问题就是该怎样积分?要积那些峰?比如RT20.336,RT21.402这种小峰是否要积;另外没有分开的峰,比如RT23.083与23.237这两个峰没有分开,是积成两个峰还一个峰。
6楼2016-04-25 19:55:46
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dzlcdutcm

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
卓越_先锋: 金币+2, 谢谢回复 2016-04-26 12:52:29
你可以选择峰面积占5%以上的或者响应值在100或150以上的,自动积分。转成cdf文件后就可以了。根据需要选吧,很多小峰稳定性不是很好,可以考虑避开。
当然你可以全部积分,在选择共有峰的时候可以选择MARK峰而不是全谱峰。
7楼2016-04-26 09:32:24
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xiulianlin

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by dzlcdutcm at 2016-04-26 09:32:24
你可以选择峰面积占5%以上的或者响应值在100或150以上的,自动积分。转成cdf文件后就可以了。根据需要选吧,很多小峰稳定性不是很好,可以考虑避开。
当然你可以全部积分,在选择共有峰的时候可以选择MARK峰而不是 ...

非常谢谢您,帮助挺大的
8楼2016-04-26 21:43:58
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20080137

新虫 (小有名气)

楼主用的什么软件?
9楼2016-05-23 15:15:33
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xiulianlin

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
9楼: Originally posted by 20080137 at 2016-05-23 15:15:33
楼主用的什么软件?

中药色谱指纹图谱相似度评价系统
10楼2016-05-23 18:54:07
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