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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 药学 » 中药学 » 中药指纹图谱数据如何前处理
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xiulianlin

新虫 (初入文坛)

[求助] 中药指纹图谱数据如何前处理 已有3人参与

刚开始做中药指纹图谱，图来后不知道如何处理数据，也就是图谱中的哪些要积分哪些峰不要积分。谢谢各位虫友！

中药指纹图谱数据如何前处理
dd.jpg
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1楼 2016-04-23 16:15:48
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绘图工作室

禁虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
卓越_先锋: 金币-50, 应助指数-1, 屏蔽内容, 违规存档, 禁止在回帖中广告 2016-04-25 18:05:44
本帖内容被屏蔽
2楼2016-04-23 16:16:36
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普思生物

专家顾问 (著名写手)

中药对照品，天然产物分离纯化

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
xiulianlin(卓越_先锋代发): 金币+2, 谢谢回复 2016-04-26 12:51:51
做指纹图谱一般要选十个批次的药材，找到共有峰，你这个图也没有对照品，没办法判断哪些峰是特征峰
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xiulianlin
3楼2016-04-23 19:54:56
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hupulang

禁虫 (初入文坛)
★ ★
感谢参与，应助指数 +1
xiulianlin(卓越_先锋代发): 金币+2, 谢谢回复 2016-04-26 12:51:58
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xiulianlin
4楼2016-04-25 14:20:45
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xiulianlin

新虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by hupulang at 2016-04-25 14:20:45
理论上应该每个峰都要积分，运用中药指纹图谱相似度计算软件进行全峰匹配才可以，具体也可参考“关于印发《中药注射剂指纹图谱研究的技术要求(暂行）》的通知“

我试了下所有的峰包括那种小峰都积分的话共有峰就差不多有50个了。另外，在匹配结果里可以看到非共有峰面积占的比例，当多点校正点选的越多时，非共有峰的面积就会越少，这个是怎么解释的呢？
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5楼2016-04-25 19:47:14
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xiulianlin

新虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by 普思生物 at 2016-04-23 19:54:56
做指纹图谱一般要选十个批次的药材，找到共有峰，你这个图也没有对照品，没办法判断哪些峰是特征峰

我做了十批的药材，也进了对照，确定了一些峰。现在的问题就是该怎样积分？要积那些峰？比如RT20.336，RT21.402这种小峰是否要积；另外没有分开的峰，比如RT23.083与23.237这两个峰没有分开，是积成两个峰还一个峰。
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6楼2016-04-25 19:55:46
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dzlcdutcm

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
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卓越_先锋: 金币+2, 谢谢回复 2016-04-26 12:52:29
你可以选择峰面积占5%以上的或者响应值在100或150以上的，自动积分。转成cdf文件后就可以了。根据需要选吧，很多小峰稳定性不是很好，可以考虑避开。
当然你可以全部积分，在选择共有峰的时候可以选择MARK峰而不是全谱峰。
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7楼2016-04-26 09:32:24
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xiulianlin

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by dzlcdutcm at 2016-04-26 09:32:24
你可以选择峰面积占5%以上的或者响应值在100或150以上的，自动积分。转成cdf文件后就可以了。根据需要选吧，很多小峰稳定性不是很好，可以考虑避开。
当然你可以全部积分，在选择共有峰的时候可以选择MARK峰而不是 ...

非常谢谢您，帮助挺大的
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8楼2016-04-26 21:43:58
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20080137

新虫 (小有名气)
楼主用的什么软件？
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9楼2016-05-23 15:15:33
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xiulianlin

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 20080137 at 2016-05-23 15:15:33
楼主用的什么软件？

中药色谱指纹图谱相似度评价系统
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10楼2016-05-23 18:54:07
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