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旎筱

新虫 (初入文坛)

[求助] ubuntu&lammps小白尝试用Python并行安装lammps【求救】

我其实就是想要一个能并行运算的lammps,

尝试用指令
python Make.py -j 16 -m mpi -a exe
去安装并行
出现报错:
Environment variable QUIP_ROOT must be set..  Stop.

然后之前出现的问题是
lmps-serial 和lammps-ubuntu都出现了,但是起不了作用。
也不知道是什么缘故失败了

我觉得我lammps的安装估计有问题,最终想达到的目标是从Python里面调用lammps和mpi4py实现对lammps的并行运算。。
现在python里面成功安装了mpi4py,但是在build lammps as a share library 这一步遇到困难,
我根本不知道2.5.2里面,make foo mode=shlib 应该在哪个文件夹里面执行这个命令哎。。

抱歉,真的都是小白。但是愿意学习,求指点,求给线索~!@smutao
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根号三在理工

新虫 (初入文坛)

楼主你好,我最近也在ububt上安装并行lammps ,但是费了很多力气都没有成功,不知道楼主哪里有没有解决了问题,可否传授一点安装经验。
2楼2016-05-05 18:03:11
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旎筱

新虫 (初入文坛)

我目前用lammps-daily还行。 然后lmp-serial 还没看懂,但是这部分在doc的说明里面写了,暂且我还是老师帮我装的

发自小木虫IOS客户端
3楼2016-05-06 16:46:03
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一次性保温杯

金虫 (小有名气)

用python装和正常渠道安装有什么差别呢
4楼2016-05-07 09:22:57
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wpppl

金虫 (小有名气)

5楼2016-05-08 00:44:07
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旎筱

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 一次性保温杯 at 2016-05-07 09:22:57
用python装和正常渠道安装有什么差别呢

感觉应该是没什么区别,方便一点吧。
6楼2016-06-12 14:50:51
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旎筱

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by wpppl at 2016-05-08 00:44:07
干什么用的啊

做分子动力学模拟的,
我是做coarse grain simulation
7楼2016-06-12 14:51:14
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一次性保温杯

金虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 旎筱 at 2016-06-11 22:50:51
感觉应该是没什么区别,方便一点吧。...

不过感觉楼主好厉害,赞一个
8楼2016-06-12 22:22:55
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旎筱

新虫 (初入文坛)

并行的没测试,但是ubuntu和serial的都ok了。要注意的是,运行的时候要输
./lmp_ubuntu
or
./lmp_serial
而不是直接lmp_ubuntu
9楼2016-06-23 11:35:23
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