24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
汕头大学海洋科学接受调剂
查看: 2039  |  回复: 8

旎筱

新虫 (初入文坛)

[求助] ubuntu&lammps小白尝试用Python并行安装lammps【求救】

我其实就是想要一个能并行运算的lammps,

尝试用指令
python Make.py -j 16 -m mpi -a exe
去安装并行
出现报错:
Environment variable QUIP_ROOT must be set..  Stop.

然后之前出现的问题是
lmps-serial 和lammps-ubuntu都出现了,但是起不了作用。
也不知道是什么缘故失败了

我觉得我lammps的安装估计有问题,最终想达到的目标是从Python里面调用lammps和mpi4py实现对lammps的并行运算。。
现在python里面成功安装了mpi4py,但是在build lammps as a share library 这一步遇到困难,
我根本不知道2.5.2里面,make foo mode=shlib 应该在哪个文件夹里面执行这个命令哎。。

抱歉,真的都是小白。但是愿意学习,求指点,求给线索~!@smutao
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

分子动力学模拟

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

根号三在理工

新虫 (初入文坛)

楼主你好,我最近也在ububt上安装并行lammps ,但是费了很多力气都没有成功,不知道楼主哪里有没有解决了问题,可否传授一点安装经验。
2楼2016-05-05 18:03:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

旎筱

新虫 (初入文坛)

我目前用lammps-daily还行。 然后lmp-serial 还没看懂,但是这部分在doc的说明里面写了,暂且我还是老师帮我装的

发自小木虫IOS客户端
3楼2016-05-06 16:46:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

一次性保温杯

金虫 (小有名气)

用python装和正常渠道安装有什么差别呢
4楼2016-05-07 09:22:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wpppl

金虫 (小有名气)

5楼2016-05-08 00:44:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

旎筱

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 一次性保温杯 at 2016-05-07 09:22:57
用python装和正常渠道安装有什么差别呢

感觉应该是没什么区别,方便一点吧。
6楼2016-06-12 14:50:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

旎筱

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by wpppl at 2016-05-08 00:44:07
干什么用的啊

做分子动力学模拟的,
我是做coarse grain simulation
7楼2016-06-12 14:51:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

一次性保温杯

金虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 旎筱 at 2016-06-11 22:50:51
感觉应该是没什么区别,方便一点吧。...

不过感觉楼主好厉害,赞一个
8楼2016-06-12 22:22:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

旎筱

新虫 (初入文坛)

并行的没测试,但是ubuntu和serial的都ok了。要注意的是,运行的时候要输
./lmp_ubuntu
or
./lmp_serial
而不是直接lmp_ubuntu
9楼2016-06-23 11:35:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 旎筱 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 245求调剂 +3 冰糖橘?汽水 2026-04-13 7/350 2026-04-13 16:42 by 冰糖橘?汽水
[考研] 0831生医工第一轮调剂失败求助 +12 小熊睿睿_s 2026-04-11 16/800 2026-04-12 16:28 by 钰璞
[考研] 277 数一104,学硕,求调剂 +21 瓶子PZ 2026-04-09 23/1150 2026-04-11 23:12 by labixiaoqiao
[考研] 086003调剂求助 +21 苏弋万 2026-04-09 22/1100 2026-04-11 20:25 by dongdian1
[考研] 284求调剂 +11 archer.. 2026-04-09 12/600 2026-04-11 20:23 by 蓝云思雨
[考研] 269求调剂 +11 啊啊我我 2026-04-07 11/550 2026-04-11 16:45 by vgtyfty
[考研] 求调剂 +10 璃茉一定上岸 2026-04-10 10/500 2026-04-11 13:31 by 1005715100
[考研] 288求调剂 +15 代fish 2026-04-09 16/800 2026-04-11 10:26 by wwj2530616
[考研] 广东省 085601 329分求调剂 +14 Eddieddd 2026-04-10 14/700 2026-04-11 09:58 by bljnqdcc
[考研] 22408 327分求调剂 +4 韵风kon 2026-04-10 4/200 2026-04-11 09:51 by 猪会飞
[考研] 337求调剂 +4 研s. 2026-04-10 4/200 2026-04-11 08:57 by zhq0425
[考研] 071000生物学调剂求助 +17 zzzzwww 2026-04-09 20/1000 2026-04-10 15:55 by 求调剂zz
[考研] 一志愿中科大070300化学,314分求调剂 +12 wakeluofu 2026-04-09 12/600 2026-04-10 09:57 by liuhuiying09
[考研] 367求调剂 +10 hffQAQ 2026-04-09 10/500 2026-04-09 18:06 by lijunpoly
[考研] 求调剂材料科学与工程一志愿985初试365分 +5 材化李可 2026-04-08 5/250 2026-04-09 17:00 by Lilly_Li
[考研] 085400电子信息类(川大控制工程)求调剂可跨专业 求老师联系 +3 626776879 2026-04-08 3/150 2026-04-09 16:05 by 猪会飞
[考研] 349学科化学045106求调剂,化学类都可以 +8 保好懂懂 2026-04-08 8/400 2026-04-09 14:03 by xulei3024
[考研] 263分B区求调剂 +6 李nihao 2026-04-08 6/300 2026-04-08 09:38 by 南开小綦
[考研] 一志愿西南090202求调剂 +4 在线求有学上 2026-04-07 4/200 2026-04-07 19:47 by biomichael
[考研] 307求调剂 +3 Youth@@ 2026-04-07 3/150 2026-04-07 09:25 by 小黑不怕难
信息提示
请填处理意见