应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 在LAMMPS的data文件中写入初始速度和位移
121/2返回列表12下一页
查看: 3122  |  回复: 11
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

qw8276617

银虫 (小有名气)

[交流] 在LAMMPS的data文件中写入初始速度和位移 已有5人参与

我看LAMMPS手册讲到，可以设置每个原子的velocity，但是并没有看到可以写入位移

并且我将速度写入data文件之后，运行一直报错

有大神知道写入速度和位移的正确格式吗？
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2016-04-14 15:55:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

alundilong

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
不知道楼主说的原子位移是什么东西？只听说过位置，坐标等。
另外，报错？报什么错？
赞一下 回复此楼
2楼2016-04-14 23:41:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abinitio

版主 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
速度不是写在data里，是在in里设置一下。其实，如果时间足够长，不设置也没问题，不过要多花些时间
赞一下 回复此楼
3楼2016-04-15 08:12:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lx_PICO

铁虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
你说的是位置差吗？要自己写程序相减得到，速度格式你先输出一个格式，然后照着弄吧
赞一下 回复此楼
4楼2016-04-15 15:11:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qw8276617

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by alundilong at 2016-04-14 23:41:40
不知道楼主说的原子位移是什么东西？只听说过位置，坐标等。
另外，报错？报什么错？

lammps可以将初始速度写入data文件的，我做的东西要求就是要把速度和位移写入data中再读取用做初始速度和位移的构建，一定是要精确写入每一个原子的

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
5楼2016-04-15 20:37:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qw8276617

银虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by lx_PICO at 2016-04-15 15:11:37
你说的是位置差吗？要自己写程序相减得到，速度格式你先输出一个格式，然后照着弄吧

不是位置差，是要写入每一个原子的初始位移，再跑分子动力学，dump出原子位移随时间的变化

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
6楼2016-04-15 20:38:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qw8276617

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by abinitio at 2016-04-15 08:12:54
速度不是写在data里，是在in里设置一下。其实，如果时间足够长，不设置也没问题，不过要多花些时间

要精确写每一个原子的速度和位移，对方回复我说的是，用c或者fortran将这两个量写入data中，但是我看手册，只能写入速度，并没有发现可以写入位移

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
7楼2016-04-15 20:40:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lx_PICO

铁虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by qw8276617 at 2016-04-15 20:38:47
不是位置差，是要写入每一个原子的初始位移，再跑分子动力学，dump出原子位移随时间的变化
...

那就fix吧
回复此楼
8楼2016-04-15 20:43:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zsilence

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
初始速度就是温度啊
赞一下 回复此楼
9楼2016-04-17 10:20:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

alundilong

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by qw8276617 at 2016-04-15 06:38:47
不是位置差，是要写入每一个原子的初始位移，再跑分子动力学，dump出原子位移随时间的变化
...

我还是在纠结楼主在楼主说的“位移”上？
请楼主仔细解释一下你说的位移的物理含义？

ps.试想，如果知道位移（位置的改变量https://zh.wikipedia.org/wiki/%E4%BD%8D%E7%A7%BB）
又知道初始速度，应该可以推得初始位置。
换句话说，知道初始速度，初始位置，不就知道初始位移了吗（注：先不计入力的作用；若计入力的作用，只是增加了加速度，而加速度完全取决于初始位置的分布）

另外，从来没听说过lammps中的data有位移这一项。（位移在MD中是求出来的，是原子的轨迹）
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

qw8276617
10楼2016-04-19 01:27:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 qw8276617 的主题更新
121/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[文学芳草园] 梦想 +5 myrtle 2026-08-26 7/350 2026-09-01 15:18 by myrtle
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗？ +4 瞬息宇宙 2026-08-31 4/200 2026-09-01 14:58 by jiaoxg
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 8/400 2026-09-01 12:58 by ssyjh
[基金申请] 国社科又开始会评了，不知道这次命运如何 +7 雨打竹帘 2026-08-30 11/550 2026-08-31 23:16 by hittle2008
[基金申请] 能否申诉？ +7 echo8914667 2026-08-30 8/400 2026-08-31 17:00 by yihongxu
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[基金申请] 为什么到现在没收到通知？ +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已，这评审意见是按照杰青的条件评的吧？ +6 gouxfjh 2026-08-28 11/550 2026-08-30 07:57 by gouxfjh
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 看板上这么多中的，有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 我不理解！ +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件，有关系吗？ +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 牛来！米来！面来！ +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭