24小时热门版块排行榜    

查看: 2847  |  回复: 11

qw8276617

银虫 (小有名气)

[交流] 在LAMMPS的data文件中写入初始速度和位移 已有5人参与

我看LAMMPS手册讲到,可以设置每个原子的velocity,但是并没有看到可以写入位移

并且我将速度写入data文件之后,运行一直报错

有大神知道写入速度和位移的正确格式吗?
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

alundilong

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
不知道楼主说的原子位移是什么东西?只听说过位置,坐标等。
另外,报错?报什么错?
2楼2016-04-14 23:41:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abinitio

版主 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
速度不是写在data里,是在in里设置一下。其实,如果时间足够长,不设置也没问题,不过要多花些时间
3楼2016-04-15 08:12:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lx_PICO

铁虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你说的是位置差吗?要自己写程序相减得到,速度格式你先输出一个格式,然后照着弄吧
4楼2016-04-15 15:11:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qw8276617

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by alundilong at 2016-04-14 23:41:40
不知道楼主说的原子位移是什么东西?只听说过位置,坐标等。
另外,报错?报什么错?

lammps可以将初始速度写入data文件的,我做的东西要求就是要把速度和位移写入data中再读取用做初始速度和位移的构建,一定是要精确写入每一个原子的

发自小木虫IOS客户端
5楼2016-04-15 20:37:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qw8276617

银虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by lx_PICO at 2016-04-15 15:11:37
你说的是位置差吗?要自己写程序相减得到,速度格式你先输出一个格式,然后照着弄吧

不是位置差,是要写入每一个原子的初始位移,再跑分子动力学,dump出原子位移随时间的变化

发自小木虫IOS客户端
6楼2016-04-15 20:38:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qw8276617

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by abinitio at 2016-04-15 08:12:54
速度不是写在data里,是在in里设置一下。其实,如果时间足够长,不设置也没问题,不过要多花些时间

要精确写每一个原子的速度和位移,对方回复我说的是,用c或者fortran将这两个量写入data中,但是我看手册,只能写入速度,并没有发现可以写入位移

发自小木虫IOS客户端
7楼2016-04-15 20:40:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lx_PICO

铁虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by qw8276617 at 2016-04-15 20:38:47
不是位置差,是要写入每一个原子的初始位移,再跑分子动力学,dump出原子位移随时间的变化
...

那就fix吧
8楼2016-04-15 20:43:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zsilence

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
初始速度就是温度啊
9楼2016-04-17 10:20:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

alundilong

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by qw8276617 at 2016-04-15 06:38:47
不是位置差,是要写入每一个原子的初始位移,再跑分子动力学,dump出原子位移随时间的变化
...

我还是在纠结楼主在楼主说的“位移”上?
请楼主仔细解释一下你说的位移的物理含义?

ps.试想,如果知道位移(位置的改变量https://zh.wikipedia.org/wiki/%E4%BD%8D%E7%A7%BB
又知道初始速度,应该可以推得初始位置。
换句话说,知道初始速度,初始位置,不就知道初始位移了吗(注:先不计入力的作用;若计入力的作用,只是增加了加速度,而加速度完全取决于初始位置的分布)

另外,从来没听说过lammps中的data有位移这一项。(位移在MD中是求出来的,是原子的轨迹)

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

10楼2016-04-19 01:27:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 qw8276617 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 北科281学硕材料求调剂 +6 tcxiaoxx 2026-03-20 6/300 2026-03-22 20:23 by edmund7
[考研] 307求调剂 +11 冷笙123 2026-03-17 11/550 2026-03-22 20:16 by edmund7
[考研] 求调剂一志愿海大,0703化学学硕304分,有大创项目,四级已过 +6 幸运哩哩 2026-03-22 10/500 2026-03-22 20:10 by edmund7
[考研] 08工科 320总分 求调剂 +11 梨花珞晚风 2026-03-17 11/550 2026-03-22 17:42 by luoyongfeng
[考研] 化学调剂 +5 yzysaa 2026-03-21 5/250 2026-03-21 22:12 by peike
[考研] 306求0703调剂一志愿华中师范 +5 纸鱼ly 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:11 by 学员8dgXkO
[考研] 299求调剂 +4 某某某某位 2026-03-21 4/200 2026-03-21 16:30 by barlinike
[考研] 268求调剂 +9 简单点0 2026-03-17 9/450 2026-03-21 15:37 by lature00
[考研] 22 350 本科985求调剂,求老登收留 +3 李轶男003 2026-03-20 3/150 2026-03-21 13:28 by 搏击518
[考研] 南昌大学材料专硕311分求调剂 +6 77chaselx 2026-03-20 6/300 2026-03-21 07:24 by JourneyLucky
[考研] 299求调剂 +6 △小透明* 2026-03-17 6/300 2026-03-21 02:42 by JourneyLucky
[考研] 材料专业求调剂 +6 hanamiko 2026-03-18 6/300 2026-03-21 00:24 by JourneyLucky
[考研] 296求调剂 +6 www_q 2026-03-18 10/500 2026-03-20 23:56 by JourneyLucky
[考研] 304求调剂 +7 司空. 2026-03-18 7/350 2026-03-20 23:08 by JourneyLucky
[考研] 085600材料与化工 +8 安全上岸! 2026-03-16 8/400 2026-03-20 22:13 by luoyongfeng
[考研] 350求调剂 +5 weudhdk 2026-03-19 5/250 2026-03-20 22:04 by luoyongfeng
[考研] 材料学硕318求调剂 +5 February_Feb 2026-03-19 5/250 2026-03-19 23:51 by 23Postgrad
[考研] 0703化学调剂 +5 pupcoco 2026-03-17 8/400 2026-03-19 13:58 by houyaoxu
[考研] 085600材料与化工求调剂 +6 绪幸与子 2026-03-17 6/300 2026-03-19 13:27 by houyaoxu
[考研] 材料专硕306英一数二 +10 z1z2z3879 2026-03-16 13/650 2026-03-18 14:20 by 007_lilei
信息提示
请填处理意见