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多多lxlgl

新虫 (小有名气)

[求助] 晶体ORTEP图和space-filling图该怎么做 已有1人参与

最近做了一个有机的盐类单晶,可是并不会解析,也不会作图,请教下各位怎么办,着急啊
先请问下图片1是用什么做出来的,这个是别人文章里的,我也需要作出类似的图。
图2是用diamond打开看到的,太乱了不知道怎么看,图3是mercury打开的expand图,感觉是个两分子盐组成的环状结构,氢键连接,请教下怎么用diamond看出这样的结构,怎么都转不出来

晶体ORTEP图和space-filling图该怎么做
图片1.png


晶体ORTEP图和space-filling图该怎么做-1
图2.png


晶体ORTEP图和space-filling图该怎么做-2
图3.png

[ Last edited by linhua0402313 on 2016-4-15 at 08:24 ]
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张在永

木虫 (正式写手)

相信自己
2楼2016-04-11 15:42:49
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多多lxlgl

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 张在永 at 2016-04-11 15:42:49
用ortep画图

不会
3楼2016-04-11 20:53:10
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张在永

木虫 (正式写手)

4楼2016-04-11 22:26:43
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木瓜少爷

至尊木虫 (文坛精英)

魔导师

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
多多lxlgl: 金币+5, ★★★很有帮助 2016-04-12 10:56:36
在diamond中模式里面选择不同的选项,这几个都能表达出来,至于氢键连接的就要先找出来氢键然后再看才能达到你在mercury中看到的效果
5楼2016-04-12 09:42:21
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多多lxlgl

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 木瓜少爷 at 2016-04-12 09:42:21
在diamond中模式里面选择不同的选项,这几个都能表达出来,至于氢键连接的就要先找出来氢键然后再看才能达到你在mercury中看到的效果

diamond打开的结构里面没有这样的环状单元,是不是应该看堆叠图,然后再找呢,应该怎么看堆叠图呢
6楼2016-04-12 10:56:28
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木瓜少爷

至尊木虫 (文坛精英)

魔导师

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by 多多lxlgl at 2016-04-12 10:56:28
diamond打开的结构里面没有这样的环状单元,是不是应该看堆叠图,然后再找呢,应该怎么看堆叠图呢...

打开堆积图,然后全部选中之后通过设置氢键参数连接氢键,然后你可以选取你想要的环状单元就可以了~
7楼2016-04-12 14:29:17
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~海带~

金虫 (初入文坛)

图一是用XP画的,diamond画图要借助mercury,先在mercury里面找出结构,再再diamond里面画,一种是先生成三维图再删掉不要的键,另一种是先画一维,再二维,再三维,一步步连出去。借助Hg看结构时还要借助PLONT看哪些氢键是存在的,以及参考一些文献值看哪些配位键是存在的哪些是不存在的。其中的奥妙,多画自然会领悟。建议先画以前师兄师姐的,能画的和他们画出来的差不多也就差不多会了,基本上属于自己摸索。

发自小木虫Android客户端
8楼2016-04-15 07:54:22
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