| 查看: 1397 | 回复: 1 | |||
hlfhehe金虫 (小有名气)
|
[求助]
Blast的时候选择同源序列与什么要求吗？ 已有1人参与
|
| Blast的时候选择同源序列与什么要求吗？另外，比对时什么时候需要序列翻转，什么时候不需要那？新手求高手指点！主要是自己做的序列树不太好! |
回复此楼» 猜你喜欢
工科材料085601 279求调剂
已经有7人回复
-
【考研调剂】化学专业 281分，一志愿四川大学，诚心求调剂
已经有6人回复
-
一志愿南昌大学，327分，材料与化工085600
已经有4人回复
-
一志愿吉林大学材料学硕321求调剂
已经有14人回复
-
材料学硕297已过四六级求调剂推荐
已经有5人回复
-
材料080500调剂求收留
已经有6人回复
-
296求调剂
已经有7人回复
-
一志愿武汉理工材料工程专硕调剂
已经有7人回复
-
295复试调剂
已经有5人回复
-
一志愿 南京航空航天大学大学 ，080500材料科学与工程学硕
已经有4人回复
haloarchaeon
金虫 (小有名气)
- 应助: 26 (小学生)
- 金币: 683
- 红花: 2
- 帖子: 70
- 在线: 27.6小时
- 虫号: 954250
- 注册: 2010-02-09
- 性别: GG
- 专业: 微生物资源与分类学
【答案】应助回帖
感谢参与，应助指数 +1
|
1、选择 Optimize for Highly similar sequences (megablast)； 2、比对不需要序列翻转。 但不建议用Blast，主要是NCBI上的好多序列都是没有甄别过，对于新手，容易误导。 建议用EzTaxon或EzFungi（http://www.ezbiocloud.net/eztaxon），比对原核微生物或真菌。 这个数据库的比对结果国际上认可。 |
2楼2016-04-10 23:17:27
