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hlfhehe金虫 (小有名气)
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Blast的时候选择同源序列与什么要求吗？ 已有1人参与
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| Blast的时候选择同源序列与什么要求吗？另外，比对时什么时候需要序列翻转，什么时候不需要那？新手求高手指点！主要是自己做的序列树不太好! |
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haloarchaeon
金虫 (小有名气)
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【答案】应助回帖
感谢参与，应助指数 +1
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1、选择 Optimize for Highly similar sequences (megablast)； 2、比对不需要序列翻转。 但不建议用Blast，主要是NCBI上的好多序列都是没有甄别过，对于新手，容易误导。 建议用EzTaxon或EzFungi（http://www.ezbiocloud.net/eztaxon），比对原核微生物或真菌。 这个数据库的比对结果国际上认可。 |
2楼2016-04-10 23:17:27