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woshidale_2006

[交流] LST文件

LIS文件中,

有关氢键有这样的描述:
Hydrogen bonds with  H..A < r(A) + 2.000 Angstroms  and   110 deg.

Alternative approximate positions for H attached to O11:
   0.0495  0.7190  0.4762  O..O10   2.634      0.1433  0.7819  0.5138  O..O4   2.741  
Alternative approximate positions for H attached to O10:
  -0.1578  0.6599  0.4538  O..O9 [ -x, -y+1, -z+1 ]  2.695     -0.1097  0.6137  0.4554  O..O8 [ -x, -y+1, -z+1 ]  2.907  
请问这个说明的是什么意思?
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huahua1216

至尊木虫 (文坛精英)


lingzi326(金币+1,VIP+0):谢谢解答
应该是O10的氢加的不好 把氢的坐标换成下面提示的计算试试
2楼2008-10-23 13:28:51
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)


lingzi326(金币+1,VIP+0):谢谢解答
O11的也不好!
xi2004-emuch@163.com
3楼2008-10-23 15:08:39
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woshidale_2006

请问1楼和2楼虫友:

氢加的不好,那能否说明O11......O4;  O10........O8是否可以认定为有氢键存在,

因为在输入XP命令画图的时候,显示这两个氢键的存在?但是O11......O4的角度是

89,这个又怎么解释呢,
4楼2008-10-24 10:53:16
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)

要想办法把氢重新加好. 从距离看肯定有氢键的. 但氢加得不对, 所以角度不对.
xi2004-emuch@163.com
5楼2008-10-24 11:20:06
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woshidale_2006

谢谢,这回我明白了。我在想办法重修一下,但是我应该怎么才能给你转金币呢,我是新手,不会转。还望告之一二。
6楼2008-10-24 11:51:11
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