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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » NAMD如何判断离子通过了离子通道
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franktang

新虫 (小有名气)

[求助] NAMD如何判断离子通过了离子通道

如题，想知道在用NAMD仿真一个镶嵌在膜上的钾离子通道时，如何判断仿真过程中钾离子通过了离子通道，从一侧移动到了另一侧，多谢！
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1楼 2016-04-07 22:15:17
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franktang

新虫 (小有名气)
2楼2016-04-08 09:36:05
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鑫鑫0001
祝福

发自小木虫Android客户端
3楼2016-04-08 10:12:23
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franktang

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 鑫鑫0001 at 2016-04-08 10:12:23
祝福

谢谢！
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4楼2016-04-08 14:48:23
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wbf3ng

金虫 (小有名气)
smd，固定蛋白，移动离子，namd主页上有教程

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5楼2016-04-09 07:11:25
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franktang

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by wbf3ng at 2016-04-09 07:11:25
smd，固定蛋白，移动离子，namd主页上有教程

太感谢了，我去找一下

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6楼2016-04-09 13:39:43
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franktang

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by wbf3ng at 2016-04-09 07:11:25
smd，固定蛋白，移动离子，namd主页上有教程

你好，不好意思还想请教一下，实际上我现在是想判断细胞膜在仿真过程中有没有发生穿孔，想借助离子的运动和分布来判断，您觉得这个方法可行吗？多谢了！
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7楼2016-04-09 17:05:26
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franktang

新虫 (小有名气)
8楼2016-04-10 22:21:07
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franktang

新虫 (小有名气)
9楼2016-04-11 20:16:31
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