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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 综合其他 » miRNA靶基因验证3'UTR
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declanzh1234

银虫 (初入文坛)

[求助] miRNA靶基因验证3'UTR 已有1人参与

如上要进行miRNA靶基因验证，在扩靶基因3'UTR时发现ensembl上3'UTR要比NCBI长好多，而miRNA种子区在ensembl3'UTR内，却没在NCBI上3'UTR内，求指导谢谢。
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1楼 2016-04-04 23:47:01
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孤单的鞋

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

靶基因3'UTR在ensembl上3'UTR内就扩ensembl上3'UTR部分啊，不然你的miRNA怎么结合，你得先把靶基因所在的细胞或者组织里提取全基因组序列，然后扩增你的靶向结合3‘UTR。NCBI上的靶基因有可能只显示CDS区，没有3’UTR?不知道我说明白没
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2楼2016-07-14 10:59:01
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