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declanzh1234

银虫 (初入文坛)

[求助] miRNA靶基因验证3'UTR已有1人参与

如上要进行miRNA靶基因验证,在扩靶基因3'UTR时发现ensembl上3'UTR要比NCBI长好多,而miRNA种子区在ensembl3'UTR内,却没在NCBI上3'UTR内,求指导谢谢。
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孤单的鞋

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

靶基因3'UTR在ensembl上3'UTR内就扩ensembl上3'UTR部分啊,不然你的miRNA怎么结合,你得先把靶基因所在的细胞或者组织里提取全基因组序列,然后扩增你的靶向结合3‘UTR。NCBI上的靶基因有可能只显示CDS区,没有3’UTR?不知道我说明白没
2楼2016-07-14 10:59:01
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