24小时热门版块排行榜    

查看: 1306  |  回复: 3

jackjiejl

木虫 (小有名气)

[求助] VESTA差分密度作图 已有1人参与

使用chgdiff.pl  得到的最后的CHGCAR_diff文件 作图得到的结果,与把CHARGE 文件导出来 在VESTA 一步一步作图 差异很大(图1  图2)
首先计算三个结构得到 CHGCAR1 CHGCAR2 CHGCAR3   (差分应该是 3-2-1)   
chgdiff.pl (CHGCAR2) (CHGCAR3)   得到  CHAGCAR32   然后 chgdiff.pl (CHGCAR1) (CHGCAR32)   得到最后的CHGCAR_diff 做图(图3)


问题   chadiff.pl  这个脚本使用有错误么?
为什么用chdif.pl 得到最后的文件作图(图3)   只剩下小分子了  骨架都消失了
图3为什么是这样显示的    跟图2 完全不一样啊

VESTA差分密度作图
差分1.PNG


VESTA差分密度作图-1
图片2.png


VESTA差分密度作图-2
3.PNG
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

加油
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

不取俗名

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我也发现这个问题

发自小木虫Android客户端
2楼2016-04-02 12:21:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jackjiejl

木虫 (小有名气)

自己顶一下
加油
3楼2016-04-02 18:18:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小赵澍儿

新虫 (初入文坛)

楼主发现问题了吗?
4楼2017-02-27 21:14:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 jackjiejl 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 北京林业大学硕导招生广告 +3 kongweilin 2026-03-26 5/250 2026-03-26 09:01 by 丶风雪夜归人丶
[考研] 一志愿上海交大生物与医药专硕324分,求调剂 +6 jiajunX 2026-03-22 6/300 2026-03-25 23:05 by licg0208
[考研] 考研调剂 +6 呼呼?~+123456 2026-03-24 6/300 2026-03-25 22:55 by 418490947
[考研] 308求调剂 +5 墨墨漠 2026-03-25 5/250 2026-03-25 22:19 by 544594351
[考研] 一志愿中南大学化学学硕0703总分337求调剂 +7 niko- 2026-03-22 7/350 2026-03-25 20:14 by qingfeng258
[考研] 0854电子信息求调剂 +7 α____ 2026-03-22 9/450 2026-03-25 13:37 by α____
[考研] 285求调剂 +3 AZMK 2026-03-24 3/150 2026-03-25 12:23 by userper
[考研] 282求调剂 +3 wcq131415 2026-03-24 3/150 2026-03-25 12:16 by userper
[考研] B区考研调剂 +4 yqdszhdap- 2026-03-22 5/250 2026-03-25 08:51 by baoball
[考研] 资源与环境 调剂申请(333分) +7 holy J 2026-03-21 7/350 2026-03-24 17:24 by xiaohai104
[考研] 080500求调剂 +3 zzzzfan 2026-03-24 3/150 2026-03-24 16:38 by barlinike
[考研] 300求调剂,材料科学英一数二 +5 leaflight 2026-03-24 5/250 2026-03-24 16:25 by laoshidan
[考研] 一志愿070300浙大化学358分,求调剂! +4 酥酥鱼.. 2026-03-21 4/200 2026-03-23 08:12 by Iveryant
[考研] 280分求调剂 一志愿085802 +4 PUMPT 2026-03-22 7/350 2026-03-22 22:13 by 星空星月
[考研] 319求调剂 +4 小力气珂珂 2026-03-20 4/200 2026-03-22 15:53 by ColorlessPI
[考研] 260求调剂 +3 朱芷琳 2026-03-20 4/200 2026-03-22 15:12 by 朱芷琳
[考研] 085600材料与化工306 +4 z1z2z3879 2026-03-21 4/200 2026-03-21 23:44 by ms629
[考研] 求调剂 +3 13341 2026-03-20 3/150 2026-03-21 18:28 by 学员8dgXkO
[考研] 求调剂 +3 @taotao 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:35 by JourneyLucky
[考研] 一志愿南理工085701环境302求调剂院校 +3 葵梓卫队 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:28 by zhukairuo
信息提示
请填处理意见