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jackjiejl

木虫 (小有名气)

[求助] VESTA差分密度作图 已有1人参与

使用chgdiff.pl  得到的最后的CHGCAR_diff文件 作图得到的结果,与把CHARGE 文件导出来 在VESTA 一步一步作图 差异很大(图1  图2)
首先计算三个结构得到 CHGCAR1 CHGCAR2 CHGCAR3   (差分应该是 3-2-1)   
chgdiff.pl (CHGCAR2) (CHGCAR3)   得到  CHAGCAR32   然后 chgdiff.pl (CHGCAR1) (CHGCAR32)   得到最后的CHGCAR_diff 做图(图3)


问题   chadiff.pl  这个脚本使用有错误么?
为什么用chdif.pl 得到最后的文件作图(图3)   只剩下小分子了  骨架都消失了
图3为什么是这样显示的    跟图2 完全不一样啊

VESTA差分密度作图
差分1.PNG


VESTA差分密度作图-1
图片2.png


VESTA差分密度作图-2
3.PNG
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加油
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不取俗名

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
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发自小木虫Android客户端
2楼2016-04-02 12:21:38
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jackjiejl

木虫 (小有名气)

自己顶一下
加油
3楼2016-04-02 18:18:25
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小赵澍儿

新虫 (初入文坛)

楼主发现问题了吗?
4楼2017-02-27 21:14:09
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