24小时热门版块排行榜    

查看: 1240  |  回复: 9

流年如梦

新虫 (正式写手)

[求助] 比对序列 已有2人参与

已知序列怎么在知网数据库里进行比对来确定这一序列属于哪一物种,哪位大神帮帮忙

发自小木虫Android客户端
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

solomon7811

新虫 (小有名气)

2楼2016-03-31 17:33:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

扶正2013

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
同意楼上,用NCBI数据库中的BLAST
3楼2016-03-31 19:36:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

流年如梦

新虫 (正式写手)

我打开知网首页没找到数据库,是直接把序列输入搜索框中搜索吗

发自小木虫Android客户端
4楼2016-03-31 20:29:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

18716248350

新虫 (小有名气)

到NCBI核酸库去粘贴序列进去,直接点blast就出来了

发自小木虫Android客户端
5楼2016-03-31 21:06:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

18716248350

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 流年如梦 at 2016-03-31 20:29:40
我打开知网首页没找到数据库,是直接把序列输入搜索框中搜索吗

不是知网,是NCBI的blast

发自小木虫Android客户端
6楼2016-03-31 21:06:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

流年如梦

新虫 (正式写手)

7楼2016-04-01 09:21:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

prthefu

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我也是这方面的新手,但我想从下面来慢慢分析。
首先,你手上是有一段基因序列是吧,那你就打开NCBI首页,找到BLAST,然后点击打开。
打开之后呢,你会看到关于BLAST的一些比对程序,因为你要比对的是基因序列,所以,点击那个“nucleotide blast”。
然后,打开之后呢,需要你在那个对话框中输入序列,但是要求是“FASTA sequence”,意思就是说先>,后面随便加个代号,比如说1,另起一行,粘贴你的序列就行。如图。
之后,再看下面,找到程序选择“program selection”,选择第三个“blastn”。
最后再点击BLAST,比对就可以出结果啦。
你可以试试,看看怎么样。
比对序列
360截图20160402092559314.jpg


比对序列-1
360截图20160402092743736.jpg


比对序列-2
360截图20160402093046009.jpg


比对序列-3
360截图20160402093249880.jpg

nothing is impossible in this world,if you have the will to win,you can achieve anything
8楼2016-04-02 09:28:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

流年如梦

新虫 (正式写手)

9楼2016-04-02 12:25:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

秦晓燕1993

新虫 (初入文坛)

10楼2016-04-03 16:30:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 流年如梦 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 40ms4Wlo4umh 2026-09-14 3/150 2026-09-15 10:02 by VMDqgnlKimtZ
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 23jxep3nCNZb 2026-09-14 3/150 2026-09-15 09:38 by VMDqgnlKimtZ
[教师之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-15 08:14 by C79jjtjAKjEn
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 4/200 2026-09-15 08:02 by C79jjtjAKjEn
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 4/200 2026-09-15 07:50 by C79jjtjAKjEn
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 4/200 2026-09-15 07:50 by C79jjtjAKjEn
[公派出国] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 3/150 2026-09-15 07:14 by C79jjtjAKjEn
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 5/250 2026-09-15 06:49 by 5BDX0d0WFp7t
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 4/200 2026-09-15 06:14 by 5BDX0d0WFp7t
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 4/200 2026-09-15 06:02 by 5BDX0d0WFp7t
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 4/200 2026-09-15 05:50 by 5BDX0d0WFp7t
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +6 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 7/350 2026-09-15 05:22 by 5BDX0d0WFp7t
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +5 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 6/300 2026-09-15 05:01 by mibUvS8DDCwf
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 4/200 2026-09-15 05:00 by mibUvS8DDCwf
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 5/250 2026-09-14 22:45 by vZfe6xYu34yj
[考博] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 5/250 2026-09-14 21:36 by vZfe6xYu34yj
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 4/200 2026-09-14 16:13 by Aj1rhIDL5ixY
[基金申请] 求教各位大神:2026教育部人文社科青年基金项目何时公示呀? +5 云宴山人 2026-09-10 7/350 2026-09-14 12:11 by ecnu2013
[找工作] 浙江师范大学是怎么坑我的 +6 recruit123 2026-09-09 6/300 2026-09-14 12:00 by 萨仁其其格
[考博] 西北工业大学材料学院电化学传感与催化课题组招收2027年推免研究生、博士生、博士后 +3 马方园 2026-09-10 4/200 2026-09-14 09:29 by Chem张zz
信息提示
请填处理意见