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流年如梦

新虫 (正式写手)

[求助] 比对序列 已有2人参与

已知序列怎么在知网数据库里进行比对来确定这一序列属于哪一物种,哪位大神帮帮忙

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solomon7811

新虫 (小有名气)

2楼2016-03-31 17:33:07
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扶正2013

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
同意楼上,用NCBI数据库中的BLAST
3楼2016-03-31 19:36:51
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流年如梦

新虫 (正式写手)

我打开知网首页没找到数据库,是直接把序列输入搜索框中搜索吗

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4楼2016-03-31 20:29:40
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18716248350

新虫 (小有名气)

到NCBI核酸库去粘贴序列进去,直接点blast就出来了

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5楼2016-03-31 21:06:14
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18716248350

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 流年如梦 at 2016-03-31 20:29:40
我打开知网首页没找到数据库,是直接把序列输入搜索框中搜索吗

不是知网,是NCBI的blast

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6楼2016-03-31 21:06:46
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流年如梦

新虫 (正式写手)

7楼2016-04-01 09:21:12
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prthefu

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我也是这方面的新手,但我想从下面来慢慢分析。
首先,你手上是有一段基因序列是吧,那你就打开NCBI首页,找到BLAST,然后点击打开。
打开之后呢,你会看到关于BLAST的一些比对程序,因为你要比对的是基因序列,所以,点击那个“nucleotide blast”。
然后,打开之后呢,需要你在那个对话框中输入序列,但是要求是“FASTA sequence”,意思就是说先>,后面随便加个代号,比如说1,另起一行,粘贴你的序列就行。如图。
之后,再看下面,找到程序选择“program selection”,选择第三个“blastn”。
最后再点击BLAST,比对就可以出结果啦。
你可以试试,看看怎么样。
比对序列
360截图20160402092559314.jpg


比对序列-1
360截图20160402092743736.jpg


比对序列-2
360截图20160402093046009.jpg


比对序列-3
360截图20160402093249880.jpg

nothing is impossible in this world,if you have the will to win,you can achieve anything
8楼2016-04-02 09:28:36
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流年如梦

新虫 (正式写手)

9楼2016-04-02 12:25:46
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秦晓燕1993

新虫 (初入文坛)

10楼2016-04-03 16:30:43
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