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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 求问，OTU 数目和物种丰度有什么关系？
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919547443

金虫 (小有名气)

[求助] 求问，OTU 数目和物种丰度有什么关系？ 已有1人参与

委托公司测得微生物，结果看不太懂。下面是给的注释。请问红色的是代表物种丰度比较大了，蓝色次之？可是otu的数目是蓝色的比红色的要多，到底是怎么看的？

根据物种注释结果，选取每个样品在各分类水平（Phylum、 Class、 Order、 Family、 Genus）上最大丰度排名前10的物种，生成物种相对丰度柱形累加图，以便直观查看各样品在不同分类水平上，相对丰度较高的物种及其比例。以门水平物种相对丰度柱形图为例展示如下

求问，OTU 数目和物种丰度有什么关系？
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1楼 2016-03-31 15:32:26
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安凉o

新虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by sunshine叮叮 at 2018-04-17 09:48:05
top10是说该门在样品中所占的比例额，OTU是操作基本单元，有可能注释不出来，有可能和其他OTU是同一个物种，所以OTU多并不是物种丰度就大!

那这个丰度是基于什么确定的哎

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5楼2020-10-22 08:41:23
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三点水木

新虫 (初入文坛)
纵坐标为不同菌占样品的百分比，不同颜色代表不同菌。表示不同样品菌群结构不同及一些菌的含量。

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2楼2016-04-22 02:05:16
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木木ZZZJ

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
1楼: Originally posted by 919547443 at 2016-03-31 15:32:26
委托公司测得微生物，结果看不太懂。下面是给的注释。请问红色的是代表物种丰度比较大了，蓝色次之？可是otu的数目是蓝色的比红色的要多，到底是怎么看的？

根据物种注释结果，选取每个样品在各分类水平（Phylum ...

请问，这个图您搞懂了没有？

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3楼2016-10-31 09:48:37
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sunshine叮叮

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

top10是说该门在样品中所占的比例额，OTU是操作基本单元，有可能注释不出来，有可能和其他OTU是同一个物种，所以OTU多并不是物种丰度就大!
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4楼2018-04-17 09:48:05
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