24小时热门版块排行榜    

查看: 928  |  回复: 0

Catherine-ru

金虫 (小有名气)

[交流] 非吸烟肺癌女性中一个新的生物标志物--- SEMA5A

Identification of a novel biomarker, SEMA5A, for non-small cell lung carcinoma in nonsmoking women
非吸烟肺癌女性中一个新的生物标志物--- SEMA5A
https://www.gcbi.com.cn/gclib/html/pubmed/detail/20802022
PMID:20802022
影响因子 :4.125
GEO相关样本: 120(GSE19804)
物种:人
主要内容:
        虽然吸烟是导致肺癌的高危因素,但是在台湾地区仅有7%的女性肺癌患者有吸烟史。非吸烟患者的肿瘤发生机制尚未明确,但是信号素是被认为有抑制肺肿瘤作用。本文综合分析了台湾地区非吸烟女性肺癌患者的分子特征,特别是生物素基因家族。
本文使用Affymetrix U133plus2.0芯片检测了60对癌症和癌旁肺组织样本。利用配对T检验筛选了肿瘤组织中的差异表达基因并且利用逆转录PCR和免疫组化进行了验证。利用IPA进行了功能分析,基因富集分析和信号通路分析。利用kaplan-Meier生存分析评估了SEMA5A的表达和临床结果关联。
我们从非小细胞肺癌中筛选了687差异表达基因,其中大部分,特别是是生物素家族基因,参与了轴突导向信号通路。肿瘤组织中SEMA5A不管在转录水平还是翻译水平都是低表达的,而且SEMA5A的低表达与非吸烟女性非小细胞肺癌的低生存率相关。
总之,一些生物素家族基因可以作为潜在的药物作用靶点,SEMA5A基因可能成为非小细胞肺癌预后的一个有效的生物标志物,也可能代表台湾地区病人的性别特异性。
        
样本信息:
本文GEO相关样本: 120例(GSE19804),为60对癌症和癌旁的配对样本。
临床信息:


推荐理由:
1.        本文有60对肺癌的配对样本,来自台湾地区,为亚洲人群,更利于我们国内利用;
2.        PMID: 21935476也利用本文的120个样本,和另一批SNP6.0芯片进行联合分析。
3.        PMID: 26656665也利用了这120个样本,研究了MDK蛋白。
分析实验室:
1.        本文中挑选出的基因为SEMA5A,可以利用网络分析,研究该基因表达一致的基因群,进一步挖掘该基因的作用途径。


史上最实在的买就送:ipad、iwatch、Kindle和迪士尼,你想要啥?

是的
GCBI迎来了第一个周年庆
谢谢您的认可
我将继续和您同在
请收下我的礼物
不过,请问你最想要哪个礼物呢?

活动详见GCBI知识库
回复此楼
勤学、修德、明辨、笃行
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 Catherine-ru 的主题更新
普通表情 高级回复(可上传附件)
信息提示
请填处理意见