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Catherine-ru金虫 (小有名气)
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非吸烟肺癌女性中一个新的生物标志物--- SEMA5A
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Identification of a novel biomarker, SEMA5A, for non-small cell lung carcinoma in nonsmoking women 非吸烟肺癌女性中一个新的生物标志物--- SEMA5A https://www.gcbi.com.cn/gclib/html/pubmed/detail/20802022 PMID:20802022 影响因子 :4.125 GEO相关样本: 120(GSE19804) 物种:人 主要内容: 虽然吸烟是导致肺癌的高危因素,但是在台湾地区仅有7%的女性肺癌患者有吸烟史。非吸烟患者的肿瘤发生机制尚未明确,但是信号素是被认为有抑制肺肿瘤作用。本文综合分析了台湾地区非吸烟女性肺癌患者的分子特征,特别是生物素基因家族。 本文使用Affymetrix U133plus2.0芯片检测了60对癌症和癌旁肺组织样本。利用配对T检验筛选了肿瘤组织中的差异表达基因并且利用逆转录PCR和免疫组化进行了验证。利用IPA进行了功能分析,基因富集分析和信号通路分析。利用kaplan-Meier生存分析评估了SEMA5A的表达和临床结果关联。 我们从非小细胞肺癌中筛选了687差异表达基因,其中大部分,特别是是生物素家族基因,参与了轴突导向信号通路。肿瘤组织中SEMA5A不管在转录水平还是翻译水平都是低表达的,而且SEMA5A的低表达与非吸烟女性非小细胞肺癌的低生存率相关。 总之,一些生物素家族基因可以作为潜在的药物作用靶点,SEMA5A基因可能成为非小细胞肺癌预后的一个有效的生物标志物,也可能代表台湾地区病人的性别特异性。 样本信息: 本文GEO相关样本: 120例(GSE19804),为60对癌症和癌旁的配对样本。 临床信息: ![]() 推荐理由: 1. 本文有60对肺癌的配对样本,来自台湾地区,为亚洲人群,更利于我们国内利用; 2. PMID: 21935476也利用本文的120个样本,和另一批SNP6.0芯片进行联合分析。 3. PMID: 26656665也利用了这120个样本,研究了MDK蛋白。 分析实验室: 1. 本文中挑选出的基因为SEMA5A,可以利用网络分析,研究该基因表达一致的基因群,进一步挖掘该基因的作用途径。 ![]() 史上最实在的买就送:ipad、iwatch、Kindle和迪士尼,你想要啥? 是的 GCBI迎来了第一个周年庆 谢谢您的认可 我将继续和您同在 请收下我的礼物 不过,请问你最想要哪个礼物呢? 活动详见GCBI知识库 |
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