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thli0572

铁虫 (初入文坛)

[求助] 重组子鉴定 已有1人参与

我用的载体是pet-15b(5708bp),然后我的目的片段是816bp,连接转化后,挑的单克隆转接液体培养基培养,之后,分别以片段引物和载体引物做初步的鉴定,附图如下(图一),然后我挑了这三个阳性的克隆抽质粒,打算送测,图如下(图二)。
现在有几个地方不太明白,我的问题是:
1. 为什么以片段引物进行PCR时会有三条条带,是不是说这个克隆不纯?(PS:我在挑单克隆的时候确实很小心的严格的挑取的)
2. 抽提质粒后,为什么在5016和6133之间会有条带?按理说条带应该是6524bp,而且就算是以开环或是线状形式或者混有细菌基因组,那也应该比螺旋跑的慢,应该至少在6133以上吧?这个看上去有点单纯地像纯质粒,如果是,那岂不是说我这个克隆不纯,那会不会影响我后续的表达实验?
谢谢!

重组子鉴定
图一,pet-15b+cd6l重组子检测,片段(左)和质粒(右)引物.jpg


重组子鉴定-1
pet15b+cd6l(1,1,2,2,11,11)-3.jpg
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atlanticwi

金虫 (正式写手)

琴美喜欢发呆 不喜欢发脾气

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
嗯..................

一切以测序结果为准,如果测序结果显示没有套峰等任何问题,且序列都对的话,就直接往下做吧
Let God do with it as He wills
2楼2016-03-28 23:25:26
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