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introns

新虫 (初入文坛)

[求助] 请问提取土壤样品中的真菌基因组DNA用什么试剂盒? 已有1人参与

各位前辈:
       我是今年开始做真菌多样性研究,想从土壤样品中提取真菌基因组DNA并进行纯化,有如下问题想请教大家。
       1:是不是一般都先用试剂盒提取、然后再用其他试剂盒纯化?分别是什么公司的什么试剂盒(能相对有效)?
       2:有没有能连同纯化一起进行的试剂盒?是什么公司的什么试剂盒?
       3:真菌基因组的琼脂糖凝胶电泳需要的marker是多大的?
       4:你们在扩增ITS区的时候,扩增的是ITS1 or ITS2? or 整个ITS区?用了哪对引物?
       希望各位前辈不吝赐教,谢谢!!
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许欧阳紫儿

新虫 (初入文坛)

我当时做的土壤细菌的多样性,提基因组没用试剂盒,后来用试剂盒纯化的

发自小木虫Android客户端
3楼2016-03-29 10:31:44
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xjldemon

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
introns: 金币+8, 有帮助 2016-03-29 15:45:47
你要进行下游PCR或者Qpcr就用MoBIo 的powersoil试剂盒吧,   2300左右,如果你只是PCR分析,其实生工的那个试剂盒也行,我做了尖孢镰刀菌的PCR,可以扩出目标片段,但是提出的DNA的浓度不是很高,盒子便宜。关于突出的DNA量大的,貌似是mpbio的试剂盒,人家裂解方式独特,需要专门的仪器配合发挥的效果才最好,没有专门的仪器只有涡旋仪也比其他的强些2700左右。以上试剂盒都是通过过柱直接纯化的,不需要再进行纯化,尤其是MObio 的有特别针对腐殖质去除的试剂,所以进行下游实验稳当些。如果以上的纯化方式还不能满足你的实验要求,那再加一步切胶回收吧,只是麻烦些,得率低些。跑基因组貌似不需要marker。ITS我没做过,所以不知道。
2楼2016-03-29 09:39:19
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introns

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xjldemon at 2016-03-29 09:39:19
你要进行下游PCR或者Qpcr就用MoBIo 的powersoil试剂盒吧,   2300左右,如果你只是PCR分析,其实生工的那个试剂盒也行,我做了尖孢镰刀菌的PCR,可以扩出目标片段,但是提出的DNA的浓度不是很高,盒子便宜。关于突 ...

哦,你说得很仔细,谢谢您。今天知道了一个叫omega的试剂盒,请问您知道这个怎么样吗?
4楼2016-03-29 15:44:39
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xjldemon

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by introns at 2016-03-29 15:44:39
哦,你说得很仔细,谢谢您。今天知道了一个叫omega的试剂盒,请问您知道这个怎么样吗?...

听说还不错,没用过。
5楼2016-03-29 16:50:59
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