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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 请问提取土壤样品中的真菌基因组DNA用什么试剂盒？
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introns

新虫 (初入文坛)

[求助] 请问提取土壤样品中的真菌基因组DNA用什么试剂盒？ 已有1人参与

各位前辈：
       我是今年开始做真菌多样性研究，想从土壤样品中提取真菌基因组DNA并进行纯化，有如下问题想请教大家。
       1：是不是一般都先用试剂盒提取、然后再用其他试剂盒纯化？分别是什么公司的什么试剂盒（能相对有效）？
       2：有没有能连同纯化一起进行的试剂盒？是什么公司的什么试剂盒？
       3：真菌基因组的琼脂糖凝胶电泳需要的marker是多大的？
       4：你们在扩增ITS区的时候，扩增的是ITS1 or ITS2？ or 整个ITS区？用了哪对引物？
       希望各位前辈不吝赐教，谢谢！！
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1楼 2016-03-28 20:59:51
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xjldemon

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
introns: 金币+8, ★有帮助 2016-03-29 15:45:47
你要进行下游PCR或者Qpcr就用MoBIo 的powersoil试剂盒吧,   2300左右，如果你只是PCR分析，其实生工的那个试剂盒也行，我做了尖孢镰刀菌的PCR，可以扩出目标片段，但是提出的ＤＮＡ的浓度不是很高，盒子便宜。关于突出的DNA量大的，貌似是mpbio的试剂盒，人家裂解方式独特，需要专门的仪器配合发挥的效果才最好，没有专门的仪器只有涡旋仪也比其他的强些2700左右。以上试剂盒都是通过过柱直接纯化的，不需要再进行纯化，尤其是MObio 的有特别针对腐殖质去除的试剂，所以进行下游实验稳当些。如果以上的纯化方式还不能满足你的实验要求，那再加一步切胶回收吧，只是麻烦些，得率低些。跑基因组貌似不需要marker。ITS我没做过，所以不知道。
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2楼2016-03-29 09:39:19
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许欧阳紫儿

新虫 (初入文坛)
我当时做的土壤细菌的多样性，提基因组没用试剂盒，后来用试剂盒纯化的

发自小木虫Android客户端
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3楼2016-03-29 10:31:44
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introns

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by xjldemon at 2016-03-29 09:39:19
你要进行下游PCR或者Qpcr就用MoBIo 的powersoil试剂盒吧,   2300左右，如果你只是PCR分析，其实生工的那个试剂盒也行，我做了尖孢镰刀菌的PCR，可以扩出目标片段，但是提出的ＤＮＡ的浓度不是很高，盒子便宜。关于突 ...

哦，你说得很仔细，谢谢您。今天知道了一个叫omega的试剂盒，请问您知道这个怎么样吗？
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4楼2016-03-29 15:44:39
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xjldemon

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by introns at 2016-03-29 15:44:39
哦，你说得很仔细，谢谢您。今天知道了一个叫omega的试剂盒，请问您知道这个怎么样吗？...

听说还不错，没用过。
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5楼2016-03-29 16:50:59
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宝杰罗生物

捐助贵宾 (小有名气)
商家已经主动声明此回帖可能含有宣传内容
用美国mobio土壤微生物强力DNA的试剂盒效果挺好的，ITS片段大概在500bp左右。
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6楼2016-03-30 11:17:03
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star013

新虫 (知名作家)
我们公司有配套的试剂盒

发自小木虫Android客户端
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7楼2016-04-01 12:07:38
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美亿美生物

捐助贵宾 (职业作家)

技术服务-实验代做
土壤提取用进口的试剂盒，专用

发自小木虫IOS客户端
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8楼2016-04-01 17:19:01
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introns

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by xjldemon at 2016-03-29 16:50:59
听说还不错，没用过。...

亲，跑基因组是需要Marker的~
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9楼2016-04-01 17:36:57
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