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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » EMSA/ChIP » 关于转录因子与靶定的顺式元件结合与激活的困惑
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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chyliu5

禁虫 (小有名气)
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1楼 2016-03-28 08:24:02
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pjxiongjing

新虫 (小有名气)
请问顺式作用元件怎么预测，酵母单杂和EMSA的方法可否分享哈，谢谢

发自小木虫Android客户端
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2楼2016-07-04 01:23:18
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_Unicorn

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

这个motif是怎么找到的？是做chip-seq 然后用DREME/MEME分析获得的吗，大概占所有reads里面的百分之多少呢？
转录因子中分析出假定的motif还是很多的，用EMSA做过的话基本可以确定是不是新的motif，
最近在看一篇关于WRKY的文章，里面也找到了一个疑似是新的cis 但是EMSA验证出来不是，希望对你有帮助。

DOI: 10.7554/eLife.07295
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3楼2018-04-04 15:14:03
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drwhoknowss

荣誉版主 (正式写手)

【答案】应助回帖

能结合，不能激活，这种情况比想要的更常见。互作因子的缺失，是可能之一。。好像抑制转录都有可能，
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Progress in science depends on new techniques, new discoveries and new ideas, probably in that order. -- Nobel laureate Sydney Brenner
4楼2018-04-05 03:30:29
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