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chyliu5

禁虫 (小有名气)

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1楼 2016-03-28 08:24:02

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pjxiongjing

新虫 (小有名气)

应助: 3 (幼儿园)
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红花: 1
帖子: 262
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虫号: 2674478
注册: 2013-09-23
专业: 植物生理与生化

请问顺式作用元件怎么预测，酵母单杂和EMSA的方法可否分享哈，谢谢

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2楼2016-07-04 01:23:18

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_Unicorn

铁虫 (小有名气)

应助: 5 (幼儿园)
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虫号: 3930266
注册: 2015-06-18
专业: 植物病理学

【答案】应助回帖

这个motif是怎么找到的？是做chip-seq 然后用DREME/MEME分析获得的吗，大概占所有reads里面的百分之多少呢？
转录因子中分析出假定的motif还是很多的，用EMSA做过的话基本可以确定是不是新的motif，
最近在看一篇关于WRKY的文章，里面也找到了一个疑似是新的cis 但是EMSA验证出来不是，希望对你有帮助。

DOI: 10.7554/eLife.07295

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3楼2018-04-04 15:14:03

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drwhoknowss

荣誉版主 (正式写手)

应助: 155 (高中生)
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专业: 人类遗传学
管辖: 分子生物

【答案】应助回帖

能结合，不能激活，这种情况比想要的更常见。互作因子的缺失，是可能之一。。好像抑制转录都有可能，

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Progress in science depends on new techniques, new discoveries and new ideas, probably in that order. -- Nobel laureate Sydney Brenner

4楼2018-04-05 03:30:29

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