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xiaoxuan1111

铁杆木虫 (正式写手)

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[求助] 求问教程里VASP算例中晶体Si的输入文件POSCAR是怎么得到的已有3人参与

算例中的POSCAR文件是这样的
system Si
5.430
0.5 0.5 0.0
0.0 0.5 0.5
0.5 0.0 0.5
2
cart
0.00 0.00 0.00
0.25 0.25 0.25
请问为什么晶体硅的原胞中只有两个原子呢？我用MS建模得到的原胞中有4个原子啊
我搜到两种获得POSCAR的方法，一个是从MS中castep的.cell文件里复制
这是我用MS中castep得到的.cell中的文件
%BLOCK LATTICE_CART
   -0.000000000000000    2.713550000000001    2.713550000000000
   2.713550000000001    0.000000000000000    2.713550000000000
   2.713550000000000    2.713550000000000    -0.000000000000001
%ENDBLOCK LATTICE_CART

%BLOCK POSITIONS_FRAC
Si 0.1250000000000000 0.1250000000000000 0.1250000000000001
Si 1.1250000000000000 0.1249999999999999  -0.3749999999999998
Si 0.1249999999999999  -0.3750000000000000 1.1250000000000000
Si  -0.3749999999999999 1.1250000000000002 0.1250000000000001
第二中方法是用MS建模后保存成.cif格式，然后导入VESTA软件，再用这个软件保存成POSCAR格式后，得到
Si
1.0
      3.8375000954       0.0000000000       0.0000000000
      1.9187500477       3.3233725696       0.0000000000
      1.9187500477       1.1077908565       3.1333057072
Si
4
Cartesian
   0.959375024       0.553895428       0.391663213
   1.918750048       1.107790857       1.958316067
   1.918750048       2.215581713       0.391663213
   2.878125072       0.553895428       0.391663213
这两种方法得到的基矢和原子坐标是不一样的，难道说它们是等价的吗？

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你想要什么，如何得到想要的，现在应该怎么做？

1楼2016-03-23 17:56:01

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xiaoxuan1111

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送红花一朵

引用回帖:

6楼: Originally posted by fzuer at 2016-03-31 09:26:07
个人认为你初始在MS中的建模就是不正确的
没有用正确的空间群信息，而是手动输入了4个分数坐标?

对于Si来说，你最简单的方法，是导入MS中自带的结构（~\share\Structures\semiconductors\Si.msi）

多说一句， ...

谢谢回复！
我空间群倒没错，我是从spring material上查到的Si晶体结构信息
http://materials.springer.com/is ... ic/docs/sd_1622696#

按它给的信息，Si的原子坐标是（1/8,1/8,1/8），用MS建模后原胞确实有4个原子，单胞有16个。
我试着改了一下原子坐标，改成（0,0,0），用MS建模后就正常了，原胞2个，单胞8个，跟MS自带的结构是一样的。

很奇怪，是我建模方法错了，还是这个数据库给的原子坐标错了呢？