| 查看: 2154 | 回复: 0 | ||
czy2010新虫 (初入文坛)
|
[求助]
全基因组甲基化测序比对率低的问题
|
| 小硕一枚，刚接手一个课题，自己从RNAlater冻存的鲤鱼肝组织提取全基因组DNA，然后甲基化建库、测序，跟鲤鱼的基因组比较，前期的2个G的数据经过质检比对后，比对率只有30%，后来调整参数，也只能达到32%的mapping efficiency，后来实在找不到原因，又让公司加测了2个G，后面一次的质量很好，但是比对率也只有45%。不知道什么原因的情况下不敢进一步测序，而且样品组织有限，轻易不敢重新提取DNA建库。组织样品是13年的，用RNAlater -80°保存的，请有经验的前辈帮忙分析是什么原因？金币不多，谢谢了！ |
回复此楼» 猜你喜欢
RMC-6291怎么用？RAS(ON) 三重复合物工具化合物的实验室实操要点
已经有0人回复
-
苯并呋咱全解析：NBD 荧光衍生化试剂母核的化学特性与实验室应用
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有172人回复
-
生物质炭与活化剂氢氧化钾混合注意事项
已经有0人回复
-
科研人必读：新一代 KRAS G12C 抑制剂 Olomorasib 的研究进展
已经有0人回复
-
BT-11（Omilancor）研究化合物全解析：从分子结构到实验应用要点
已经有0人回复
-
富马酸贝达喹啉：二芳基喹啉类工具化合物的化学特征
已经有0人回复
-
BT投稿with editor状态快两周了，正常吗
已经有25人回复
-
Silevertinib（BDTX-1535）结构拆解：炔基双环片段为何成为合成瓶颈
已经有0人回复
-
RO4929097 解析：双苯并氮杂䓬骨架与 Notch 通路实验设计要点
已经有0人回复
-
分子量 1157 的 PROTAC 怎么配不析出：SGK3-PROTAC1 的溶解、分装与图谱复核
已经有0人回复