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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 求助1、cat_dcd用法，2、金纳米粒子参数问题
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yylcx

金虫 (正式写手)

[求助] 求助1、cat_dcd用法，2、金纳米粒子参数问题 已有1人参与

各位虫友，1）请问有谁可以帮忙教一下catdcd的用法呢，我用NAMD得到的轨迹太大，VMD加载不动了。。。。。
            2）最近想模拟金纳米粒子，但是却被金纳米粒子的参数难住了。。。。。
跪求各位大神帮忙~奉上金币
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1楼 2016-03-22 21:09:15
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声梦奇缘001

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
yylcx: 金币+5, ★★★很有帮助 2016-03-23 09:16:27
catdcd的使用请参见，压缩包中的 readme文件，里面有很详细的介绍！  金原子的参数可以参考lammps中的EAM势，里面有相应的参数。或者是查看文献 JPCC,122，17281
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只做不说，明知没地位，坚信有机会
2楼2016-03-23 08:17:06
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yylcx

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 声梦奇缘001 at 2016-03-23 08:17:06
catdcd的使用请参见，压缩包中的 readme文件，里面有很详细的介绍！  金原子的参数可以参考lammps中的EAM势，里面有相应的参数。或者是查看文献 JPCC,122，17281

非常感谢，我这就去看一下，如果有不明白的可能还要向您请教啊，
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3楼2016-03-23 09:17:00
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yylcx

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 声梦奇缘001 at 2016-03-23 08:17:06
catdcd的使用请参见，压缩包中的 readme文件，里面有很详细的介绍！  金原子的参数可以参考lammps中的EAM势，里面有相应的参数。或者是查看文献 JPCC,122，17281

非常不好意思，我在catdcd的压缩包中没有找到readme文件啊，难道是指VMD的压缩包下面的某一个readme文件中么？
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4楼2016-03-23 10:03:29
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yylcx

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 声梦奇缘001 at 2016-03-23 08:17:06
catdcd的使用请参见，压缩包中的 readme文件，里面有很详细的介绍！  金原子的参数可以参考lammps中的EAM势，里面有相应的参数。或者是查看文献 JPCC,122，17281

找到了呢，再次感谢哈
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5楼2016-03-23 10:20:37
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yylcx

金虫 (正式写手)
这些文件夹。。是指catdcd不能在windows下用了么。。。而且我还没安装成功，被自己蠢哭了
求助1、cat_dcd用法，2、金纳米粒子参数问题
B5ZHC_@}V44[{Y]FP~28)(2.png
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6楼2016-03-23 10:46:01
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w18732182109

新虫 (初入文坛)
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7楼2016-03-24 14:36:42
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小树苗旭儿

铁虫 (小有名气)
姐姐，我做的金纳米粒子为什么总是会出现黑色的物质啊？溶液都不会变成红色，做了两次都是这样，容器也都用王水泡了。这是为什么呀。
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爱拼才会赢
8楼2016-04-09 10:11:09
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yylcx

金虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 小树苗旭儿 at 2016-04-09 10:11:09
姐姐，我做的金纳米粒子为什么总是会出现黑色的物质啊？溶液都不会变成红色，做了两次都是这样，容器也都用王水泡了。这是为什么呀。

额，我不做实验。。。还真是不懂
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9楼2016-04-09 11:10:05
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