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新手求教，g_bond 和 g_angle不会用，快死掉了，求大神救救 已有1人参与
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本人在学习MD的初期阶段，并不太了解各大函数的具体使用方法 最近对一个10bp的DNA分子进行了一个柔性模拟，得出了相应的xtc，trr等文件，我现在希望将每一个构象中某三个原子的角度以及某两个原子键长随构象的变化函数分析出来（也就是随时间的变化），可惜不会使用g_bond 和 g_angle 这两个函数的说，求大神帮下忙怎么搞？  |
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我有手册，我是一个核酸分子跑完md后，生成了log,xtc,trr,edr 等文件，我想对这个分子进行键长键角分析，就是画出某一个键长或某一个键角同时间的图像，但是那两个函数需要ndx文件索引，怎么把跑完后存在于xtc中或者trr文件中的信息提取出来以适用于键长或键角分析？大神求指点，别嫌金币少，小弟真心只有这么多，跪拜大神 发自小木虫IOS客户端 |
3楼2016-03-19 15:08:23
jerkwin
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【答案】应助回帖
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看看程序文档和手册吧, 很简单的 http://jerkwin.github.io/9999/12 ... %E6%96%87%E6%A1%A3/ http://jerkwin.github.io/GMX/GMXman-8/#section-9 |
2楼2016-03-19 00:20:24
jerkwin
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4楼2016-03-20 00:01:52
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5楼2016-03-22 20:44:13
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