24小时热门版块排行榜    

查看: 3921  |  回复: 6

houyanhui8

铜虫 (小有名气)

[求助] 求助将下列atat的str.out格式转变为poscar格式 已有2人参与

求高人指点:将下列atat的str.out格式转变为poscar格式

1.000000 0.000000 0.000000
0.000000 1.000000 0.000000
0.000000 0.000000 1.000000
-2.000000 -1.000000 1.000000
-2.000000 1.000000 -1.000000
2.000000 -1.000000 -1.000000
-1.000000 -1.000000 -1.000000 a_B
-2.500000 -0.500000 -0.000000 a_B
-0.000000 -1.500000 -0.500000 a_A
-1.500000 -1.000000 0.500000 a_A
-2.500000 -0.000000 -0.500000 a_A
-2.000000 -0.500000 -0.500000 a_A
-0.000000 -1.000000 -1.000000 a_B
-1.500000 -1.000000 -0.500000 a_A
-1.500000 -0.500000 0.000000 a_A
-1.000000 -1.000000 0.000000 a_A
-1.000000 -0.500000 -1.500000 a_B
-0.500000 -1.500000 -0.000000 a_B
-0.000000 -0.500000 -1.500000 a_B
-1.500000 -0.500000 -1.000000 a_A
-1.500000 0.000000 -0.500000 a_B
-1.000000 -0.500000 -0.500000 a_B
1.000000 -1.000000 -1.000000 a_A
-0.500000 -1.000000 -0.500000 a_B
-0.500000 -0.500000 0.000000 a_B
-2.000000 0.000000 -1.000000 a_A
-1.500000 0.500000 -1.000000 a_A
-1.000000 0.000000 -1.000000 a_B
-1.000000 -1.500000 -0.500000 a_B
-0.500000 -0.500000 -1.000000 a_B
-0.500000 0.000000 -0.500000 a_B
0.000000 -0.500000 -0.500000 a_A
-2.000000 -1.000000 -1.000000 a_B
0.500000 -1.000000 -0.500000 a_B
-0.500000 -0.000000 -1.500000 a_A
-2.000000 -1.000000 0.000000 a_A
0.500000 -0.500000 -1.000000 a_A
-3.000000 -0.500000 -0.500000 a_A
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cahndengbin

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2016-03-19 09:35:08
可以这样解决,假设上述文件为pos
1. 用atat里的命令str2cif将pos文件转换为cif文件,str2cif <pos >pos.cif
2.下载一个cif2cell程序,使用cif2cell将cif文件转化为vasp格式的POSCAR cif2cell  -f pos.cif -p vasp --vasp-cartesian-lattice-vectors。或者用vesta,导入cif文件,export VASP格式的POSCAR文件。
2楼2016-03-18 14:27:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

houyanhui8

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cahndengbin at 2016-03-18 14:27:42
可以这样解决,假设上述文件为pos
1. 用atat里的命令str2cif将pos文件转换为cif文件,str2cif <pos >pos.cif
2.下载一个cif2cell程序,使用cif2cell将cif文件转化为vasp格式的POSCAR cif2cell  -f pos.cif  ...

可以帮忙转以下吗?
3楼2016-03-18 17:39:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cahndengbin

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by houyanhui8 at 2016-03-18 17:39:20
可以帮忙转以下吗?...

已经如此详细的告诉方法了,请自己去学。
4楼2016-03-21 11:05:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hpfamily1988

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

ATAT中有两个命令就是把ATAT里的str.out和warp文件转换成vasp的输入文件。
1. str2ezvasp 把str.out和warp输入文件整合成vasp.in文件
2. ezvap -n vasp.in 把vasp转换成vasp输入文件POSCAR等。
你可以试试。
5楼2016-03-22 11:52:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

beibei8311

金虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by hpfamily1988 at 2016-03-22 11:52:19
ATAT中有两个命令就是把ATAT里的str.out和warp文件转换成vasp的输入文件。
1. str2ezvasp 把str.out和warp输入文件整合成vasp.in文件
2. ezvap -n vasp.in 把vasp转换成vasp输入文件POSCAR等。
你可以试试。

您好  我最近在学ATAT mcsqs  ,  我提交了个48原子的结构,但是一天过去了,mcsqs.log 没有更新,文件夹里面也没什么best.sqs.out 等文件,想问下是不是出什么问题了?
6楼2016-11-15 15:50:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Brilliantly

捐助贵宾 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cahndengbin at 2016-03-18 14:27:42
可以这样解决,假设上述文件为pos
1. 用atat里的命令str2cif将pos文件转换为cif文件,str2cif &lt;pos &gt;pos.cif
2.下载一个cif2cell程序,使用cif2cell将cif文件转化为vasp格式的POSCAR cif2cell  -f  ...

很棒
加油!
7楼2020-08-16 21:50:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 houyanhui8 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿中国海洋大学,生物学,301分,求调剂 +3 1孙悟空 2026-03-17 3/150 2026-03-18 10:28 by macy2011
[考研] 298-一志愿中国农业大学-求调剂 +4 手机用户 2026-03-17 4/200 2026-03-18 09:30 by b不易
[考研] 293求调剂 +11 zjl的号 2026-03-16 16/800 2026-03-18 08:10 by zhukairuo
[考研] 341求调剂 +5 捣蛋猪猪 2026-03-11 7/350 2026-03-17 19:09 by 捣蛋猪猪
[考研] 344求调剂 +4 knight344 2026-03-16 4/200 2026-03-17 17:27 by ruiyingmiao
[考研] 302求调剂 +9 负心者当诛 2026-03-11 9/450 2026-03-17 17:13 by ruiyingmiao
[考研] 有没有道铁/土木的想调剂南林,给自己招师弟中~ +3 TqlXswl 2026-03-16 7/350 2026-03-17 15:23 by TqlXswl
[考研] 290求调剂 +6 孔志浩 2026-03-12 11/550 2026-03-17 14:41 by 周舟舟77
[考研] 278求调剂 +3 Yy7400 2026-03-13 3/150 2026-03-17 08:24 by laoshidan
[基金申请] 国自科面上基金字体 +6 iwuli 2026-03-12 7/350 2026-03-16 21:18 by sculhf
[考研] 一志愿211 0703方向310分求调剂 +3 努力奋斗112 2026-03-15 3/150 2026-03-16 16:44 by houyaoxu
[考研] 311求调剂 +5 26研0 2026-03-15 5/250 2026-03-16 16:21 by a不易
[考研] 085600材料与化工 求调剂 +13 enenenhui 2026-03-13 14/700 2026-03-16 15:19 by 了了了了。。
[考研] 328求调剂 +3 5201314Lsy! 2026-03-13 6/300 2026-03-14 15:31 by hyswxzs
[考研] 一志愿哈工大材料324分求调剂 +5 闫旭东 2026-03-14 5/250 2026-03-14 14:53 by 木瓜膏
[考研] 求材料调剂 085600英一数二总分302 前三科235 精通机器学习 一志愿哈工大 +4 林yaxin 2026-03-12 4/200 2026-03-13 22:04 by 星空星月
[考研] 0856材料与化工301求调剂 +5 奕束光 2026-03-13 5/250 2026-03-13 22:00 by 星空星月
[考研] 材料与化工085600调剂求老师收留 +9 jiaanl 2026-03-11 9/450 2026-03-13 20:22 by JourneyLucky
[考研] 工科278分求调剂 +5 周慢热啊 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:49 by JourneyLucky
[考研] 314求调剂 +7 无懈可击的巨人 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:40 by JourneyLucky
信息提示
请填处理意见