应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 求助将下列atat的str.out格式转变为poscar格式
71/1返回列表
查看: 3920  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

houyanhui8

铜虫 (小有名气)

[求助] 求助将下列atat的str.out格式转变为poscar格式 已有2人参与

求高人指点：将下列atat的str.out格式转变为poscar格式

1.000000 0.000000 0.000000
0.000000 1.000000 0.000000
0.000000 0.000000 1.000000
-2.000000 -1.000000 1.000000
-2.000000 1.000000 -1.000000
2.000000 -1.000000 -1.000000
-1.000000 -1.000000 -1.000000 a_B
-2.500000 -0.500000 -0.000000 a_B
-0.000000 -1.500000 -0.500000 a_A
-1.500000 -1.000000 0.500000 a_A
-2.500000 -0.000000 -0.500000 a_A
-2.000000 -0.500000 -0.500000 a_A
-0.000000 -1.000000 -1.000000 a_B
-1.500000 -1.000000 -0.500000 a_A
-1.500000 -0.500000 0.000000 a_A
-1.000000 -1.000000 0.000000 a_A
-1.000000 -0.500000 -1.500000 a_B
-0.500000 -1.500000 -0.000000 a_B
-0.000000 -0.500000 -1.500000 a_B
-1.500000 -0.500000 -1.000000 a_A
-1.500000 0.000000 -0.500000 a_B
-1.000000 -0.500000 -0.500000 a_B
1.000000 -1.000000 -1.000000 a_A
-0.500000 -1.000000 -0.500000 a_B
-0.500000 -0.500000 0.000000 a_B
-2.000000 0.000000 -1.000000 a_A
-1.500000 0.500000 -1.000000 a_A
-1.000000 0.000000 -1.000000 a_B
-1.000000 -1.500000 -0.500000 a_B
-0.500000 -0.500000 -1.000000 a_B
-0.500000 0.000000 -0.500000 a_B
0.000000 -0.500000 -0.500000 a_A
-2.000000 -1.000000 -1.000000 a_B
0.500000 -1.000000 -0.500000 a_B
-0.500000 -0.000000 -1.500000 a_A
-2.000000 -1.000000 0.000000 a_A
0.500000 -0.500000 -1.000000 a_A
-3.000000 -0.500000 -0.500000 a_A
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2016-03-18 14:08:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cahndengbin

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2016-03-19 09:35:08
可以这样解决，假设上述文件为pos
1. 用atat里的命令str2cif将pos文件转换为cif文件，str2cif <pos >pos.cif
2.下载一个cif2cell程序，使用cif2cell将cif文件转化为vasp格式的POSCAR cif2cell  -f pos.cif -p vasp --vasp-cartesian-lattice-vectors。或者用vesta，导入cif文件，export VASP格式的POSCAR文件。
赞一下(3人) 回复此楼
2楼2016-03-18 14:27:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

houyanhui8

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by cahndengbin at 2016-03-18 14:27:42
可以这样解决，假设上述文件为pos
1. 用atat里的命令str2cif将pos文件转换为cif文件，str2cif <pos >pos.cif
2.下载一个cif2cell程序，使用cif2cell将cif文件转化为vasp格式的POSCAR cif2cell  -f pos.cif  ...

可以帮忙转以下吗？
赞一下 回复此楼
3楼2016-03-18 17:39:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cahndengbin

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by houyanhui8 at 2016-03-18 17:39:20
可以帮忙转以下吗？...

已经如此详细的告诉方法了，请自己去学。
赞一下 回复此楼
4楼2016-03-21 11:05:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hpfamily1988

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

ATAT中有两个命令就是把ATAT里的str.out和warp文件转换成vasp的输入文件。
1. str2ezvasp 把str.out和warp输入文件整合成vasp.in文件
2. ezvap -n vasp.in 把vasp转换成vasp输入文件POSCAR等。
你可以试试。
赞一下 回复此楼
5楼2016-03-22 11:52:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

beibei8311

金虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by hpfamily1988 at 2016-03-22 11:52:19
ATAT中有两个命令就是把ATAT里的str.out和warp文件转换成vasp的输入文件。
1. str2ezvasp 把str.out和warp输入文件整合成vasp.in文件
2. ezvap -n vasp.in 把vasp转换成vasp输入文件POSCAR等。
你可以试试。

您好  我最近在学ATAT mcsqs  ，  我提交了个48原子的结构，但是一天过去了，mcsqs.log 没有更新，文件夹里面也没什么best.sqs.out 等文件，想问下是不是出什么问题了?
赞一下 回复此楼
6楼2016-11-15 15:50:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Brilliantly

捐助贵宾 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by cahndengbin at 2016-03-18 14:27:42
可以这样解决，假设上述文件为pos
1. 用atat里的命令str2cif将pos文件转换为cif文件，str2cif &lt;pos &gt;pos.cif
2.下载一个cif2cell程序，使用cif2cell将cif文件转化为vasp格式的POSCAR cif2cell  -f  ...

很棒
回复此楼
加油！
7楼2020-08-16 21:50:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 houyanhui8 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 265求调剂 +3 梁梁校校 2026-03-17 3/150 2026-03-18 09:12 by zhukairuo
[考研] 281求调剂（0805） +3 烟汐忆海 2026-03-16 9/450 2026-03-18 07:23 by 烟汐忆海
[考研] 299求调剂 +4 △小透明* 2026-03-17 4/200 2026-03-17 20:09 by peike
[考研] 341求调剂 +5 捣蛋猪猪 2026-03-11 7/350 2026-03-17 19:09 by 捣蛋猪猪
[考研] 材料工程专硕调剂 +5 204818@lcx 2026-03-17 5/250 2026-03-17 17:27 by Little-xue
[考研] 302求调剂 +9 负心者当诛 2026-03-11 9/450 2026-03-17 17:13 by ruiyingmiao
[考研] 梁成伟老师课题组欢迎你的加入 +8 一鸭鸭哟 2026-03-14 10/500 2026-03-17 15:07 by 一鸭鸭哟
[考研] 211本，11408一志愿中科院277分，曾在中科院自动化所实习 +6 Losir 2026-03-12 7/350 2026-03-17 12:09 by danranxie
[考研] 286求调剂 +3 lemonzzn 2026-03-16 5/250 2026-03-16 20:43 by lemonzzn
[考研] 326求调剂 +4 诺贝尔化学奖觊� 2026-03-15 7/350 2026-03-16 17:11 by 诺贝尔化学奖觊�
[考研] 0703化学调剂 +6 妮妮ninicgb 2026-03-15 9/450 2026-03-16 16:40 by houyaoxu
[考研] 0703化学调剂 290分有科研经历，论文在投 +7 腻腻gk 2026-03-14 7/350 2026-03-16 10:12 by houyaoxu
[考研] 中科大材料与化工319求调剂 +3 孟鑫材料 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:10 by ms629
[考研] 297一志愿上交085600求调剂 +5 指尖八千里 2026-03-14 5/250 2026-03-14 17:26 by a不易
[考研] ［0860］321分求调剂，ab区皆可 +4 宝贵热 2026-03-13 4/200 2026-03-13 22:01 by 星空星月
[考研] 281求调剂 +9 Koxui 2026-03-12 11/550 2026-03-13 20:50 by Koxui
[考研] 【考研调剂求收留】 +3 Ceciilia 2026-03-11 3/150 2026-03-13 20:18 by JourneyLucky
[考研] 290求调剂 +3 ADT 2026-03-13 3/150 2026-03-13 10:19 by peike
[考研] 270求调剂 085600材料与化工专硕 +3 YXCT 2026-03-11 3/150 2026-03-13 10:13 by houyaoxu
[考研] 321求调剂（食品/专硕） +3 xc321 2026-03-12 6/300 2026-03-13 08:45 by xc321
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭