Znn3bq.jpeg
查看: 681  |  回复: 5

yumibaobao

新虫 (初入文坛)

[求助] 基因组中预测一类酶 已有1人参与

求助大神们,本人刚刚进行了一株真菌的全基因组测序,注释后得到了预测的所有基因及其编码的蛋白,现在想从这些蛋白中寻找所有可能的倍半萜合成酶,要怎么做啊?有没有网站或者软件可以做到啊?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

黑藻先生

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
以你测序的蛋白当做database,找一个/些已知的你要的酶的序列,做本地BLAST。
2楼2016-03-18 18:24:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

金家女王

铁虫 (小有名气)

不好意思  我想问一下  做真菌全基因测序的时候  survey的结果有什么用吗  还是只是能够得到基因的大小  GC百分比这样的基础的东西  为后续精细图做铺垫?
3楼2016-05-09 21:04:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yumibaobao

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 金家女王 at 2016-05-09 21:04:37
不好意思  我想问一下  做真菌全基因测序的时候  survey的结果有什么用吗  还是只是能够得到基因的大小  GC百分比这样的基础的东西  为后续精细图做铺垫?

只看结果的话是这样的,后续的分析挖掘都要有一些软件网站数据库来完成
4楼2016-05-10 13:01:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

金家女王

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by yumibaobao at 2016-05-10 13:01:26
只看结果的话是这样的,后续的分析挖掘都要有一些软件网站数据库来完成...

那是不是我们自己分析非常麻烦  应该让公司继续进行分析呢?
5楼2016-05-10 18:31:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

biosci

捐助贵宾 (职业作家)


倍半萜合成酶可以预测出来的,然后可以用工业酿酒酵母进行表达,获得药用萜类产物

发自小木虫Android客户端
6楼2016-05-10 21:10:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yumibaobao 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 华师大读博 +3 xq83 2026-04-22 3/150 2026-04-22 03:56 by 啊哒哒哒叨
[论文投稿] 急需审稿人!!! +3 陆小果画大饼 2026-04-21 3/150 2026-04-21 23:54 by jzy_123456
[考博] 申博/考博 +4 啃面包的小书虫 2026-04-17 8/400 2026-04-21 16:26 by 啃面包的小书虫
[考研] 一志愿A区211,22408 321求调剂 +7 随心所欲☆ 2026-04-15 8/400 2026-04-21 08:22 by Equinoxhua
[论文投稿] 期刊推荐 +3 材料研究生 2026-04-15 5/250 2026-04-20 16:02 by 豆豆7758
[论文投稿] 有没有接收比较快的sci期刊呀,最好在一个月之内的,研三孩子求毕业 20+4 之护着 2026-04-16 7/350 2026-04-20 15:45 by 豆豆7758
[教师之家] 又一批高校组建人工智能学院 师资行吗 不是骗人吗 +4 yexuqing 2026-04-19 4/200 2026-04-20 14:47 by brantleo
[考研] 337求调剂 +3 jyz04 2026-04-18 3/150 2026-04-20 12:24 by 研可安
[考研] 求计算机方向调剂 +3 Toffee2 2026-04-16 6/300 2026-04-19 22:37 by ll叶
[考研] 304求调剂 +8 castLight 2026-04-16 8/400 2026-04-19 17:14 by 中豫男
[考研] 求调剂 +10 小聂爱学习 2026-04-16 12/600 2026-04-19 16:51 by 中豫男
[考研] 求调剂 +6 苦命人。。。 2026-04-18 7/350 2026-04-19 16:27 by 中豫男
[考研] 294求调剂 +15 淡然654321 2026-04-15 15/750 2026-04-19 08:20 by cuisz
[考研] 0854求调剂 +23 门路摸摸 2026-04-15 27/1350 2026-04-19 01:59 by 烟雨流涯
[考研] 300求调剂 +12 橙a777 2026-04-15 12/600 2026-04-18 23:51 by 路病情
[考研] 接受任何调剂 +6 也就是栗子 2026-04-17 7/350 2026-04-18 17:20 by 涵竹刘
[考研] 收到复试调剂但是去不了 +8 小蜗牛* 2026-04-16 8/400 2026-04-18 11:15 by zixin2025
[考研] 260求调剂 +4 Zyt1314520.. 2026-04-17 5/250 2026-04-18 08:28 by babysonlkd
[考研] 急需调剂 +9 绝不放弃22 2026-04-15 10/500 2026-04-18 08:09 by chixmc
[考研] 322求调剂 +6 tekuzu 2026-04-17 6/300 2026-04-17 13:48 by Espannnnnol
信息提示
请填处理意见