应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 基因组中预测一类酶
61/1返回列表
查看: 644  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

yumibaobao

新虫 (初入文坛)

[求助] 基因组中预测一类酶 已有1人参与

求助大神们，本人刚刚进行了一株真菌的全基因组测序，注释后得到了预测的所有基因及其编码的蛋白，现在想从这些蛋白中寻找所有可能的倍半萜合成酶，要怎么做啊？有没有网站或者软件可以做到啊？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2016-03-16 11:10:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

黑藻先生

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
以你测序的蛋白当做database，找一个/些已知的你要的酶的序列，做本地BLAST。
赞一下 回复此楼
2楼2016-03-18 18:24:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

金家女王

铁虫 (小有名气)
不好意思  我想问一下  做真菌全基因测序的时候  survey的结果有什么用吗  还是只是能够得到基因的大小  GC百分比这样的基础的东西  为后续精细图做铺垫？
赞一下 回复此楼
3楼2016-05-09 21:04:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yumibaobao

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 金家女王 at 2016-05-09 21:04:37
不好意思  我想问一下  做真菌全基因测序的时候  survey的结果有什么用吗  还是只是能够得到基因的大小  GC百分比这样的基础的东西  为后续精细图做铺垫？

只看结果的话是这样的，后续的分析挖掘都要有一些软件网站数据库来完成
赞一下 回复此楼
4楼2016-05-10 13:01:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

金家女王

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by yumibaobao at 2016-05-10 13:01:26
只看结果的话是这样的，后续的分析挖掘都要有一些软件网站数据库来完成...

那是不是我们自己分析非常麻烦  应该让公司继续进行分析呢？
赞一下 回复此楼
5楼2016-05-10 18:31:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

biosci

捐助贵宾 (职业作家)
倍半萜合成酶可以预测出来的，然后可以用工业酿酒酵母进行表达，获得药用萜类产物

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
6楼2016-05-10 21:10:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yumibaobao 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭