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矮矬穷

银虫 (著名写手)

[交流] 求分子模拟的同学帮忙

本人做催化,有些基元反应的活化能只能通过计算获得,但是我对计算实在是一窍不通,量子化学都没学过,组里也没人懂,简直是无从下手,请教大神如果我想计算活化能该怎么做?
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chuntao118

新虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★
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矮矬穷: 金币+5 2016-03-11 20:37:58
真心讲很难,我也不懂,但是最好沿着组里同学的路走下去,这样比较好!另起楼灶,好难!要是老板还不能提供相应的好的可供参考的资源,无异于盲人摸象!
2楼2016-03-11 20:34:11
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矮矬穷

银虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by chuntao118 at 2016-03-11 20:34:11
真心讲很难,我也不懂,但是最好沿着组里同学的路走下去,这样比较好!另起楼灶,好难!要是老板还不能提供相应的好的可供参考的资源,无异于盲人摸象!

谢谢回复。我知道很难,但是难也得做啊
3楼2016-03-11 20:37:52
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alundilong

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★
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矮矬穷: 金币+5 2016-03-12 21:14:05
这方面的程序比较多吧。Gaussian啥的。计算活化能的例子也有的。
http://www.gaussian.com/g_whitepap/thermo.htm
这个网页有这个例子。
4楼2016-03-12 06:11:49
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preach0519

木虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
矮矬穷: 金币+10 2016-03-13 10:38:52
简单的反应 知道反应物和产物吗?高斯应该可以算的 可以交流下
自己才是最靠得住的人!
5楼2016-03-13 09:50:19
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矮矬穷

银虫 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by preach0519 at 2016-03-13 09:50:19
简单的反应 知道反应物和产物吗?高斯应该可以算的 可以交流下

这是个固液非均相催化反应的一个基元步骤,构成催化循环的最后一环,所以反应物和产物都是吸附在催化剂表面的物种,具体的结构不知道

发自小木虫Android客户端
6楼2016-03-13 10:38:37
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preach0519

木虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by 矮矬穷 at 2016-03-13 10:38:37
这是个固液非均相催化反应的一个基元步骤,构成催化循环的最后一环,所以反应物和产物都是吸附在催化剂表面的物种,具体的结构不知道
...

我不是做催化的 但是要计算反应 或者你催化剂的结构知道 可以计算一下 单一物种的能量 再做个吸附以后的能量 我理解是这样
自己才是最靠得住的人!
7楼2016-03-13 16:29:34
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8913813

铜虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
催化的计算,,因为涉及到晶体,一般用MS或者VASP计算,不过上手真的挺难的,有人教你的话可以走很多弯路。Gaussian很少算晶体,一般计算气相的分子,个人见解。
8楼2016-03-24 10:51:20
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8913813

铜虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
另外做反应机理计算,你要先确定(设计)可能的反应路径,优化各个反应物,过渡态,中间体,产物的结构,计算各个反应物,过渡态,中间体,产物的能量,根据反应的能垒(活化能,过渡态能量-反应物能量)判断可能的反应路径。这里面刚接触这方面人可能遇到的困难一个是结构的建立优化,一个是过渡态的寻找吧。
9楼2016-03-24 10:57:31
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wang_121

新虫 (初入文坛)


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楼主你好,问题解决了吗,我最近也在做基元反应的模拟,求分享经验,

发自小木虫IOS客户端
10楼2021-03-16 08:51:07
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