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矮矬穷

银虫 (著名写手)

[交流] 求分子模拟的同学帮忙

本人做催化，有些基元反应的活化能只能通过计算获得，但是我对计算实在是一窍不通，量子化学都没学过，组里也没人懂，简直是无从下手，请教大神如果我想计算活化能该怎么做？
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1楼 2016-03-11 20:04:46
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chuntao118

新虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
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矮矬穷: 金币+5 2016-03-11 20:37:58
真心讲很难，我也不懂，但是最好沿着组里同学的路走下去，这样比较好！另起楼灶，好难！要是老板还不能提供相应的好的可供参考的资源，无异于盲人摸象！
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2楼2016-03-11 20:34:11
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矮矬穷

银虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by chuntao118 at 2016-03-11 20:34:11
真心讲很难，我也不懂，但是最好沿着组里同学的路走下去，这样比较好！另起楼灶，好难！要是老板还不能提供相应的好的可供参考的资源，无异于盲人摸象！

谢谢回复。我知道很难，但是难也得做啊
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3楼2016-03-11 20:37:52
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alundilong

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
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矮矬穷: 金币+5 2016-03-12 21:14:05
这方面的程序比较多吧。Gaussian啥的。计算活化能的例子也有的。
http://www.gaussian.com/g_whitepap/thermo.htm
这个网页有这个例子。
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4楼2016-03-12 06:11:49
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preach0519

木虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
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矮矬穷: 金币+10 2016-03-13 10:38:52
简单的反应 知道反应物和产物吗？高斯应该可以算的 可以交流下
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自己才是最靠得住的人！
5楼2016-03-13 09:50:19
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矮矬穷

银虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by preach0519 at 2016-03-13 09:50:19
简单的反应 知道反应物和产物吗？高斯应该可以算的 可以交流下

这是个固液非均相催化反应的一个基元步骤，构成催化循环的最后一环，所以反应物和产物都是吸附在催化剂表面的物种，具体的结构不知道

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6楼2016-03-13 10:38:37
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preach0519

木虫 (小有名气)
★
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引用回帖:
6楼: Originally posted by 矮矬穷 at 2016-03-13 10:38:37
这是个固液非均相催化反应的一个基元步骤，构成催化循环的最后一环，所以反应物和产物都是吸附在催化剂表面的物种，具体的结构不知道
...

我不是做催化的 但是要计算反应 或者你催化剂的结构知道 可以计算一下 单一物种的能量 再做个吸附以后的能量 我理解是这样
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7楼2016-03-13 16:29:34
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8913813

铜虫 (初入文坛)
★
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催化的计算，，因为涉及到晶体，一般用MS或者VASP计算，不过上手真的挺难的，有人教你的话可以走很多弯路。Gaussian很少算晶体，一般计算气相的分子，个人见解。
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8楼2016-03-24 10:51:20
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8913813

铜虫 (初入文坛)
★
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另外做反应机理计算，你要先确定（设计）可能的反应路径，优化各个反应物，过渡态，中间体，产物的结构，计算各个反应物，过渡态，中间体，产物的能量，根据反应的能垒（活化能，过渡态能量-反应物能量）判断可能的反应路径。这里面刚接触这方面人可能遇到的困难一个是结构的建立优化，一个是过渡态的寻找吧。
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9楼2016-03-24 10:57:31
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wang_121

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
楼主你好，问题解决了吗，我最近也在做基元反应的模拟，求分享经验，

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10楼2021-03-16 08:51:07
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