应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 利用GOLD分子对接，怎么设置参数更好的让它考虑金属配位作用
51/1返回列表
查看: 1420  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

6946147

木虫 (小有名气)

[求助] 利用GOLD分子对接，怎么设置参数更好的让它考虑金属配位作用 已有2人参与

请教一个问题，在用GOLD对接时，直接按照默认参数对配体分子进行对接时效果较好，但是对接我的分子效果相当差，好像没有考虑金属配位作用，我需要进行什么样的设置才行呢？
我的蛋白是含有血红素的细胞色素P450酶，配体分子中含有咪唑环，应该能与铁形成配位键，但是在对接过程中不能考虑这个配位键。希望精通GOLD的同志能够给予帮助，非常感谢！！！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
Thefuturebelongstothosewhobelieveinthebeautyoftheirdreams.
1楼 2016-03-11 18:27:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Real穗

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

想请问楼主，您这个问题最终是怎样解决的？我现在遇到了同样的问题，在GOLD中，也是对接的金属酶，GOLD不识别金属，不知道怎么解决，期待您的回复。
赞一下 回复此楼
6楼2018-07-05 21:33:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

你丫有病吧

新虫 (初入文坛)
楼主有gold软件嘛，求安装

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
2楼2016-12-13 09:53:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhanglu33

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

不算精通，但刚好也在做这个。给我邮箱，我发篇文献给你看看。
赞一下 回复此楼
3楼2016-12-17 15:14:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

6946147

木虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by zhanglu33 at 2016-12-17 15:14:24
不算精通，但刚好也在做这个。给我邮箱，我发篇文献给你看看。

谢谢哈  文献链接给我一下吧
赞一下 回复此楼
Thefuturebelongstothosewhobelieveinthebeautyoftheirdreams.
4楼2016-12-18 21:53:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +8 majunge000 2026-08-10 9/450 2026-08-12 22:17 by 虫友是什么虫
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见，大家看看几个A，几个B? +10 Tide man 2026-08-11 10/500 2026-08-12 20:59 by 陈晨晨陈啊
[基金申请] 好奇怪的filecode +5 布布和一二 2026-08-08 6/300 2026-08-12 16:11 by 云上清扬
[基金申请] FileCode能看出啥？ +8 要乐观耀哥 2026-08-10 21/1050 2026-08-12 16:08 by 云上清扬
[基金申请] 长年满屏的广告，版主太不责任了。基金也等的急 +4 gltch 2026-08-12 4/200 2026-08-12 16:08 by eulota
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +22 Lanmanbaby 2026-08-09 35/1750 2026-08-12 14:38 by sdfapple719
[论文投稿] 职称评审，求友友推荐见刊最快的期刊 +4 工厂打螺丝 2026-08-08 4/200 2026-08-12 09:18 by hansi2025
[基金申请] 奇怪，两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +7 布布和一二 2026-08-10 10/500 2026-08-12 09:12 by 布布和一二
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果？ +3 yuleib84 2026-08-11 3/150 2026-08-11 21:53 by jnhyjjm
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 什么时候出结果，有咨询渠道？？？ +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 我的国基提前知道中了，可是同事的操作让我实在接受不了，怎么会有这样的人 +8 家与远方 2026-08-10 13/650 2026-08-11 09:49 by 家与远方
[基金申请] 确定了，国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 静等基金结果 +5 gjjjzhong 2026-08-10 16/800 2026-08-10 17:19 by Tide man
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] fileCode有新解读？ +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于豆爷回答的JTJC与%2F数量 +5 yang182083 2026-08-06 7/350 2026-08-08 18:29 by zhanghaozhu
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变，有变的大神么？ +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[基金申请] filecode +14 等待解的谜 2026-08-06 19/950 2026-08-07 12:20 by wlwhappy
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭