应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 利用GOLD分子对接，怎么设置参数更好的让它考虑金属配位作用
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
61/1返回列表
查看: 1277  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

6946147

木虫 (小有名气)

[求助] 利用GOLD分子对接，怎么设置参数更好的让它考虑金属配位作用 已有2人参与

请教一个问题，在用GOLD对接时，直接按照默认参数对配体分子进行对接时效果较好，但是对接我的分子效果相当差，好像没有考虑金属配位作用，我需要进行什么样的设置才行呢？
我的蛋白是含有血红素的细胞色素P450酶，配体分子中含有咪唑环，应该能与铁形成配位键，但是在对接过程中不能考虑这个配位键。希望精通GOLD的同志能够给予帮助，非常感谢！！！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
Thefuturebelongstothosewhobelieveinthebeautyoftheirdreams.
1楼 2016-03-11 18:27:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

你丫有病吧

新虫 (初入文坛)
楼主有gold软件嘛，求安装

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
2楼2016-12-13 09:53:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhanglu33

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

不算精通，但刚好也在做这个。给我邮箱，我发篇文献给你看看。
赞一下 回复此楼
3楼2016-12-17 15:14:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

6946147

木虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by zhanglu33 at 2016-12-17 15:14:24
不算精通，但刚好也在做这个。给我邮箱，我发篇文献给你看看。

谢谢哈  文献链接给我一下吧
赞一下 回复此楼
Thefuturebelongstothosewhobelieveinthebeautyoftheirdreams.
4楼2016-12-18 21:53:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhanglu33

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 6946147 at 2016-12-18 21:53:16
谢谢哈  文献链接给我一下吧...

PROTEINS: Structure, Function, and Bioinformatics 58:836–844 (2005)
赞一下 回复此楼
5楼2016-12-19 08:46:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Real穗

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

想请问楼主，您这个问题最终是怎样解决的？我现在遇到了同样的问题，在GOLD中，也是对接的金属酶，GOLD不识别金属，不知道怎么解决，期待您的回复。
赞一下 回复此楼
6楼2018-07-05 21:33:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 6946147 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 305求调剂 +3 RuiFairyrui 2026-03-28 3/150 2026-03-28 17:41 by 王小欠i
[考研] 一志愿北京工业大学，324分求调剂 +4 零八# 2026-03-28 4/200 2026-03-28 15:01 by 17865157980
[考研] 304求调剂 +6 曼殊2266 2026-03-27 6/300 2026-03-28 14:10 by 唐沐儿
[考研] 求调剂 +6 芦lty 2026-03-25 7/350 2026-03-28 13:13 by 唐沐儿
[考研] 085602 307分 求调剂 +7 不知道叫什么！ 2026-03-26 7/350 2026-03-28 09:57 by 神马都不懂
[考研] 085405 考的11408求各位老师带走 +3 Qiu学ing 2026-03-28 3/150 2026-03-28 09:19 by 乐呵呵的追梦人
[考研] 283求调剂（080500） +4 A child 2026-03-27 4/200 2026-03-27 15:34 by XPU李庆
[考研] 287求调剂 +10 land xuxu 2026-03-26 10/500 2026-03-27 15:33 by 帕尔马拉特
[考研] 292求调剂 +4 求求了收下我吧� 2026-03-26 4/200 2026-03-27 10:37 by zhshch
[考研] 0703化学338求调剂！ +6 Zuhui0306 2026-03-26 7/350 2026-03-27 10:35 by shangxh
[考研] 324求调剂 +8 hanamiko 2026-03-26 10/500 2026-03-27 08:06 by hypershenger
[考研] 086003食品工程求调剂 +6 淼淼111 2026-03-24 6/300 2026-03-25 10:29 by 3Strings
[考研] B区考研调剂 +4 yqdszhdap－ 2026-03-22 5/250 2026-03-25 08:51 by baoball
[考研] 080500求调剂 +3 zzzzfan 2026-03-24 3/150 2026-03-24 16:38 by barlinike
[考研] 305分求调剂（食品工程） +5 Sxy112 2026-03-21 7/350 2026-03-24 12:27 by 544594351
[考研] 335求调剂 +4 yuyu宇 2026-03-23 5/250 2026-03-23 23:49 by Txy@872106
[考研] 284求调剂 +3 yanzhixue111 2026-03-23 6/300 2026-03-23 22:58 by pswait
[考研] 384求调剂 +3 子系博 2026-03-22 6/300 2026-03-23 21:45 by 子系博
[考研] 一志愿重庆大学085700资源与环境，总分308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-23 8/400 2026-03-23 20:36 by Creta
[考研] 315分，诚求调剂，材料与化工085600 +3 13756423260 2026-03-22 3/150 2026-03-22 20:11 by edmund7
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭