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PSIBLAST生成 PSSM时间很长
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万能的虫友我用如下命令： psiblast -db nr -query 2PG3_A.fasta.txt -num_iterations 3 -evalue 0.001 -out_ascii_pssm 2PG3_A 获取pssm，可是至少需要20分钟才能得到结果。是我的命令错了还是nr数据太大造成的？（我用psiblast -in_msa 2PG3_A.fasta.txt -out_ascii_pssm pssm1.txt -subject 2PG3_A.fasta.txt很快就得到了结果。没有金币了  ）。 |
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