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小小苏26

新虫 (初入文坛)

[求助] rDNA-ITS序列两两比较 已有1人参与

在做rDNA-ITS序列两两比较,不会啊,又懂的大神神神援手吧,小女子在此先谢过!!!
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草溪河

铁虫 (著名写手)

看看DNA序列比对相关的资料吧

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2楼2016-03-11 13:31:51
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小小苏26

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 草溪河 at 2016-03-11 13:31:51
看看DNA序列比对相关的资料吧

可以推荐下吗?看文献都说的现成的,没有软件如何操作啊。。。
3楼2016-03-11 13:33:54
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草溪河

铁虫 (著名写手)

也不知道你两两比较是要做什么?说明什么问题?是要比较相似度同源性吗?

发自小木虫Android客户端
4楼2016-03-11 13:34:21
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草溪河

铁虫 (著名写手)

ITS序列一般常用来对真菌进行鉴定,或者结合其他保守基因作聚类分析

发自小木虫Android客户端
5楼2016-03-11 13:36:52
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小小苏26

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 草溪河 at 2016-03-11 13:34:21
也不知道你两两比较是要做什么?说明什么问题?是要比较相似度同源性吗?

对的,就是要比较同源性、遗传距离、和差异度。
6楼2016-03-11 13:38:48
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草溪河

铁虫 (著名写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 小小苏26 at 2016-03-11 13:38:48
对的,就是要比较同源性、遗传距离、和差异度。...

你这还挺深的。之前只涉及过用ITS做简单的鉴定,对于你这不太熟悉。建议看看有关的生物信息学吧,主要是进化分析。软件及教程的话,一般论坛里都会有的。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

7楼2016-03-11 13:49:18
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小小苏26

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by 草溪河 at 2016-03-11 13:49:18
你这还挺深的。之前只涉及过用ITS做简单的鉴定,对于你这不太熟悉。建议看看有关的生物信息学吧,主要是进化分析。软件及教程的话,一般论坛里都会有的。...

嗯,谢谢楼楼!
8楼2016-03-11 13:51:16
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haloarchaeon

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
内容已删除
haloarchaeon
9楼2016-03-11 17:00:34
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