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janetfull

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】autodock计算结果不可重复

我用autodock4计算,所用的都是默认的设置,但是重复3次之后,结果都不一样,请问各位高手,这是为什么?
[search]autodock4[/search]

[ Last edited by mingdong on 2009-9-19 at 08:04 ]
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janetfull

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by nh13 at 2008-10-17 08:18:
Autodock使用的是拉马克遗传算法,这种最优化方法就是重复性差的。应该再用其他对接软件比较一下比较好吧。

为什么这种算法,重复性查呢?
11楼2008-10-18 00:10:20
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xuzhj01

金虫 (小有名气)

程序采用的算法导致结果没有重复性

程序采用的算法导致结果没有重复性,例如 遗传算法等。。。。  顺便问LZ可有ADT的windows版本,近期官网无法下载,我正好要用,非常感谢。
2楼2008-10-15 20:46:56
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janetfull

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by xuzhj01 at 2008-10-15 20:46:
程序采用的算法导致结果没有重复性,例如 遗传算法等。。。。  顺便问LZ可有ADT的windows版本,近期官网无法下载,我正好要用,非常感谢。

谢谢你的回帖,我想问你一下,大概为什么那个算法就能导致他没有重复性? 那我如果做了3次的话,哪次的结果更可信?这个该怎么选择?

谢谢。
3楼2008-10-16 08:45:20
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)

同样的输入文件会造成很大的不同吗?即使有一些不同,但也不会有很大的差异的。
4楼2008-10-16 09:42:20
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