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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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shirley--

金虫 (小有名气)

[交流] 细菌16s rDNA鉴定

细菌16s rDNA测序结果出来后,不知道怎么分析了,求教各位小伙伴。看了很多人说测序出来的不完整,对序列比对应该有很大的影响吧?

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有朋自远方来,不亦说乎
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joshuablack

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
手工也可以做呀,两端测序大概得到两个800左右的序列,看看两端测定误差大干扰强的信号有多少,删掉,拼接(我用的contig1),blast,选近似菌种构建发育树

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2楼2016-03-09 10:28:02
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shirley--

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by joshuablack at 2016-03-09 10:28:02
手工也可以做呀,两端测序大概得到两个800左右的序列,看看两端测定误差大干扰强的信号有多少,删掉,拼接(我用的contig1),blast,选近似菌种构建发育树

测序公司已经帮忙拼接好了呢,发现拼接好的序列前后端少了大概一百多个bp,会对比对有太大影响吗?求教

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有朋自远方来,不亦说乎
3楼2016-03-09 11:05:21
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