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求助从两个不同表型找差异基因的方法
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soutree
木虫
(正式写手)
应助: 1
(幼儿园)
金币: 5596.1
帖子: 369
在线: 88.1小时
虫号: 947440
[交流]
求助从两个不同表型找差异基因的方法
如题,目前手头有两个表型不一样的拟南芥植株,我们想从两者中找到影响表型变化的差异基因,不知道用什么方法靠谱一些。
求大神给些提示,做哪些会有帮助?
初步想做RNA-seq,不知道哪个公司做的好一点?
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1楼
2016-03-08 12:00:20
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KOP利
新虫
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应助: 15
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虫号: 4255798
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
23楼
:
Originally posted by
soutree
at 2016-03-08 16:09:34
嗯,我也是帮别人问的,才知道是因为转基因造成的表型差异,想做转录组,想知道国内哪家公司转录组做的好,分析的好,价格便宜? 如果方便的话,麻烦你帮我问问吧,十分感谢!
...
好吧,那是确定要用转录组测序去分析了,对吗?我给你问过我师姐了,她之前做micro RNA测序是在上海英拜生物科技有限公司做的,师姐说当时做的是1个样本4500元,包括实验、测序加所有的数据分析服务。但转录组测序不知道多少钱一个样本,不过我听师姐说现在测序实验的价格都降下来了,转录组是最常规的,肯定比micro RNA测序便宜。你参考这个4500元的价格去问公司吧,比这个贵的就不要做了。我这边是上海六院糖尿病研究所的。不知道你是哪里?
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soutree
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24楼
2016-03-09 13:33:35
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fengyuran
新虫
(正式写手)
应助: 11
(小学生)
金币: 64.7
帖子: 679
在线: 120.9小时
虫号: 2368769
★
soutree(金币+1): 谢谢参与
你确定不同表型是SNP造成的吗?
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7楼
2016-03-08 13:37:06
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这只是暂时的
5楼
2016-03-08 13:20
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soutree(金币+1): 谢谢参与
祝福
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